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J-GLOBAL ID：201702221667828920   整理番号：17A0099824

AEROMONAS AH10(CCTCC AB2014155)の全ゲノム配列決定と比較分析【JST・京大機械翻訳】

Whole-genome sequencing and comparative analysis of Aeromonas hydrophila AH10 (CCTCC AB2014155)

著者 (5件)： Zhang Guoliang (National Pathogen Collection Center for Aquatic Animals, Key Laboratory of Freshwater and Germplasm Resources Utilization, Ministry of Agriculture; College of Fisheries and Life Science, Shanghai Ocean University) ,  Wang Hao (National Pathogen Collection Center for Aquatic Animals, Key Laboratory of Freshwater and Germplasm Resources Utilization, Ministry of Agriculture; College of Fisheries and Life Science, Shanghai Ocean University) ,  Zhang Ye (National Pathogen Collection Center for Aquatic Animals, Key Laboratory of Freshwater and Germplasm Resources Utilization, Ministry of Agriculture; College of Fisheries and Life Science, Shanghai Ocean University) ,  Xu Dan (National Pathogen Collection Center for Aquatic Animals, Key Laboratory of Freshwater and Germplasm Resources Utilization, Ministry of Agriculture; College of Fisheries and Life Science, Shanghai Ocean University) ,  Lu Liqun (National Pathogen Collection Center for Aquatic Animals, Key Laboratory of Freshwater and Germplasm Resources Utilization, Ministry of Agriculture; College of Fisheries and Life Science, Shanghai Ocean University, Aquaculture Collaborative Innovation Center of Hubei Province)
資料名： Zhongguo Shuichan Kexue  (Zhongguo Shuichan Kexue)
巻： 23  号： 5  ページ： 995-1005  発行年： 2016年 
JST資料番号： C2255A  ISSN： 1005-8737  CODEN： ZSKEFS  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： 中国 (CHN)  言語： 中国語 (ZH)

抄録/ポイント： 解嗜 水のゲノム情報の構造と機能を調べるために,AEROMONAS HYDROPHILA(AH HYDROPHILA)AH10(CCTCC保証:ABAB)について全ゲノム配列決定を行った。抽出したAH10の全ゲノムDNAを断片化し,ライブラリーを構築した。ゲノムを組み立て,アノテーションと比較分析を行った。結果は以下を示した。AH10の全ゲノム配列の全長は4.91MBであり、GC含有量は61.1%であり、合計4570個の遺伝子を予測し、3351個の遺伝子は明確な生物学的機能を有する。共個の遺伝子はオーソログ(CLUSTER OF ORTHOLOGOUS GROUPS,COG)の分類を持ち、1281個は代謝経路に関連する遺伝子、遺伝子は31個である。ゲノム学的研究を比較した。AH10のSNPは点102481BPであり,AEROMONAS HYDROPHILA YL17遺伝子と最も良い直線性を示した。米国 HYDROPHILA ATCC 7966は,アメリカの源 ATCC 7966と類似していた。AH10の病原性は溶血素遺伝子HLY(HEMOLYSIN GENE),アエロリシン遺伝子AER(AEROLYSIN GENE),カドヘリン遺伝子AHAL(MAJOR GENE GENE),セリンプロテアーゼ遺伝子AHP(セリン PROTEASE GENE),細胞興奮性エンテロトキシン遺伝子ALT(CYTOTONIC ENTEROTOXIN GENE)と密接に関連している。これらの遺伝子はAEROMONAS HYDROPHILAにおいて高い相同性を示した。自体誘導物シグナル分子-2(AUTOINDUCER-2)と合成シグナル分子酵素遺伝子(SIGNAL)と転写調節タンパク質遺伝子(TRANSCRIPTIONAL REGULAR GENE, AHYR)のクオラムセンシング(QUORUM SENSING, QS)システムが存在する。III型分泌系(TYPE III SECRETION SYSTEM, TTSS)は存在しない。AH10の全ゲノム配列に対して比較的全面的なアノテーションと比較統計分析を行い、行いの分子生物学的研究に理論的支持を提供した。Data from the ScienceChina, LCAS. Translated by JST【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 病原性 ,  アノテーション ,  セリンプロテイナーゼ ,  分子生物学 ,  溶血素 ,  遺伝子 ,  *ゲノム ,  代謝経路 ,  相同性
準シソーラス用語： クオラムセンシング ,  転写調節 ,  シグナル分子 ,  ゲノミクス ,  ゲノムDNA ,  *ゲノム配列 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (4件)： Aeromonas hydrophila ,  genome sequencing ,  gene ,  comparative analysis

分類 (1件)： 遺伝子の構造と化学  (EC02020U)

タイトルに関連する用語 (3件)： Aeromonas ,  ゲノム配列 ,  比較分析