文献

J-GLOBAL ID：201702224487003391   整理番号：17A0200848

リンゴMDSWEET1遺伝子のバイオインフォマティクスと発現解析【JST・京大機械翻訳】

Bioinformatics and Expression Analysis of Gene MdSWEET1 in Malus×domestica

著者 (10件)： Wen Xin (College of Biological Engineering, Shanxi University) ,  Deng Shu (Shanxi Academy of Agricultural Sciences Pomology Institute) ,  Luo Huizhen (College of Biological Engineering, Shanxi University) ,  Zhang Chunfen (Shanxi Academy of Agricultural Sciences Pomology Institute) ,  Feng Liyun (College of Biological Engineering, Shanxi University) ,  Xiao Rong (Shanxi Academy of Agricultural Sciences Pomology Institute) ,  Nie Yuanjun (Agricultural resource and Economic Research Institute, Shanxi Academy of Agriculture Sciences) ,  Li Qian (Biotechnology Research Center, Shanxi Academy of Agriculture Sciences) ,  Ren Ying (Biotechnology Research Center, Shanxi Academy of Agriculture Sciences) ,  Cao Qiufen (College of Biological Engineering, Shanxi University)
資料名： Fenzi Zhiwu Yuzhong  (Fenzi Zhiwu Yuzhong)
巻： 14  号： 10  ページ： 2623-2629  発行年： 2016年 
JST資料番号： C2681A  ISSN： 1672-416X  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： 中国 (CHN)  言語： 中国語 (ZH)

抄録/ポイント： 糖輸送体質は新しく発見されたタンパク質として動植物に広く存在し、植物の花蜜の生産と種子、花粉の発育に重要な役割を果たしている。本研究では、本研究グループが獲得した新しい遺伝子MDSWEET1をバイオインフォマティクスソフトを用いて分析し、リアルタイム蛍光定量PCRを用いて、異なる時間帯におけるリンゴの葯におけるこの遺伝子の発現量を分析した。バイオインフォマティクス解析の結果は以下のことを示した。MDSWEET1のCDNAは342BPのオープンリーディングフレーム(ORF)を含み、113のアミノ酸をコードし、相対分子質量は12.985KD、等電点は点8.93であり、この遺伝子コードタンパクの二次構造は主にランダムコイルとΑ-螺旋から構成されている。中間介在物はΒ-シートに分布した。3つの膜貫通ドメインがあり,N末端は外膜に位置している。配列解析により,MDSWEET1が他の種で発見されたアミノ酸配列と相同性が低いことを示した。リアルタイム蛍光定量分析により、低温前処理したリンゴ葯におけるMDSWEET1遺伝子発現量は冷処理時間の増加に伴い低下傾向を示し、低温前処理はMDSWEET1遺伝子の発現を阻害し、その機能に影響することが分かった。これらの結果は,MDSWEET1のリンゴ花粉稔性への影響を理解するための理論的基礎を提供した。Data from the ScienceChina, LCAS. Translated by JST【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 分子量 ,  花粉 ,  *リンゴ ,  低温 ,  グルコース輸送体 ,  アミノ酸配列 ,  等電点 ,  蛍光 ,  *遺伝子 ,  前処理 ,  相同性 ,  定量的PCR法 ,  アミノ酸
準シソーラス用語： オープンリーディングフレーム ,  *バイオインフォマティクス , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： Apple ,  SWEET1 ,  Bioinformatics ,  Cold pre-treatment ,  Expression

分類 (2件)： 遺伝子の構造と化学  (EC02020U) ,  分子遺伝学一般  (EC02010J)

タイトルに関連する用語 (4件)： リンゴ ,  遺伝子 ,  バイオインフォマティクス ,  発現解析