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J-GLOBAL ID：201702229724027661   整理番号：17A0062941

ハイスループット配列決定に基づく猪鞭虫雌,雄の差異遺伝子発現解析【JST・京大機械翻訳】

Differential Expression Analysis of Female and Male Trichuris suis by a High-throughput Transcriptome Sequencing Method

著者 (5件)： Zhou Zuoyong (Department of Veterinary Medicine,Rongchang Campus of Southwest University) ,  Shao Aojun (Department of Veterinary Medicine,Rongchang Campus of Southwest University) ,  Xu Tingting (College of Animal Science and Technology,Southwest University) ,  Chen Jialei (College of Animal Science and Technology,Southwest University) ,  Hu Shijun (Department of Veterinary Medicine,Rongchang Campus of Southwest University)
資料名： Xumu Shouyi Xuebao  (Xumu Shouyi Xuebao)
巻： 47  号： 9  ページ： 1914-1923  発行年： 2016年 
JST資料番号： C2231A  ISSN： 0366-6964  CODEN： CMHPAI  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： 中国 (CHN)  言語： 中国語 (ZH)

抄録/ポイント： ブタ(SUIS SUIS)の雌と雄のトランスクリプトームの差異を明らかにするために、ILLUMINA トランスクリプトーム 2000を用いて、臨床で採集されたT.SUISの雌、雄に対してハイスループットシークエンシングを行った。得られたUNIGENESをNR,GO,COGおよびKEGGデータベースにアノテーションし,差異発現遺伝子解析を行った。その結果,T.SUISと雌は,それぞれ59と854の高品質配列を得て,それぞれ21のととUNIGENESのUNIGENESを得た。これらの結果は,NR,NR,KEGG,およびKEGGデータベースが,それぞれ11,,,,,および9であることを示した。雄のUNIGENESの数はそれぞれ12,,,1およびとであり,NRデータベースによる84.90の情報はブタの鞭に由来することを示した。4つの異なる発現遺伝子が,雌と雌の間で見つかった。雌を対照として、雄の合計に個の遺伝子発現がアップレギュレーションされ、824個の遺伝子発現が低下した。合計906の差次的発現遺伝子が得られ,それらのうち,7つの経路が著しく濃縮された。T.SUISのトランスクリプトームにおいて、多くの重要な遺伝子の発現が発見され、T.SUISの繁殖に関連する主要な精子タンパク質、ヒストンH2/2B及びビテロゲニンが含まれる。T.SUIS病原性,免疫および炎症調節に関わるプロテアーゼ,セリンプロテアーゼ阻害分子およびシステインプロテアーゼ阻害分子,および多くの未知機能の遺伝子である。本研究では、T.SUISの雄、雄の差異発現遺伝子の数量を明らかにし、これらの差異発現遺伝子の機能、分類及び代謝経路のアノテーションを獲得し、T.SUISのトランスクリプトーム情報を豊かにし、鞭と宿主の相互作用の特徴及び抗鞭の研究開発に基礎を築いた。Data from the ScienceChina, LCAS. Translated by JST【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 病原性 ,  トランスクリプトーム ,  システインプロテイナーゼ ,  アップレギュレーション ,  データベース ,  代謝経路 ,  プロテイナーゼ ,  *遺伝子 ,  セリンプロテイナーゼ ,  精子 ,  アノテーション
準シソーラス用語： 遺伝子解析 ,  KEGG ,  *遺伝子発現プロファイリング ,  *ハイスループット , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (4件)： Trichuris suis ,  transcriptome ,  gene annotation ,  differentially expressed genes

分類 (5件)： 遺伝子発現  (EC02040Q) ,  分子遺伝学一般  (EC02010J) ,  遺伝子の構造と化学  (EC02020U) ,  稲作  (FC03020C) ,  食品の汚染  (FJ01053P)

タイトルに関連する用語 (7件)： ハイスループット ,  猪 ,  鞭虫 ,  雌 ,  雄 ,  差異 ,  遺伝子発現解析