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J-GLOBAL ID：201702230609222638   整理番号：17A0159781

コブノの細菌群集構造と多様性解析【JST・京大機械翻訳】

Analysis of the bacterial community structure and diversity in the intestine of Cnaphalocrocis medinalis(Lepidoptera: Pyralidae)

著者 (6件)： Liu Xiaogai (College of Plant Protection, Southwest University, State Key Laboratory Breeding Base for Zhejiang Sustainable Pest and Disease Control) ,  Yang Yajun (State Key Laboratory Breeding Base for Zhejiang Sustainable Pest and Disease Control, Institute of Plant Protection and Microbiology, Zhejiang Academy of Agricultural Sciences) ,  Liao Qiuju (College of Plant Protection, Southwest University) ,  Xu Hongxing (State Key Laboratory Breeding Base for Zhejiang Sustainable Pest and Disease Control, Institute of Plant Protection and Microbiology, Zhejiang Academy of Agricultural Sciences) ,  Liu Yinghong (College of Plant Protection, Southwest University, State Key Laboratory Breeding Base for Zhejiang Sustainable Pest and Disease Control) ,  Lu Zhongxian (State Key Laboratory Breeding Base for Zhejiang Sustainable Pest and Disease Control, Institute of Plant Protection and Microbiology, Zhejiang Academy of Agricultural Sciences)
資料名： Kunchong Xuebao  (Kunchong Xuebao)
巻： 59  号： 9  ページ： 965-976  発行年： 2016年 
JST資料番号： W1455A  ISSN： 0454-6296  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： 中国 (CHN)  言語： 中国語 (ZH)

抄録/ポイント： 【目的】本研究の目的は,イネの主要害虫であるコブノ MEDINALIS(GUENEE)の腸内細菌の群集構造と多様性を明らかにすることであった。【方法】ILLUMINA 4を用いて,イネ 4の4齢幼虫の16S RDNA V3-V4変異区配列を配列決定した。USEARCHととソフトウェアを用いて,サンプル配列数と操作分類ユニット(OPERATIONALSTATE TAXONOMIC UNIT,OTU)の数を整理し,4齢幼虫腸道の細菌の種組成,豊度と多様性を分析した。【結果】4つの4齢幼虫(1,2,3および5頭)の合計コブノのREADSを,4つの個体群の間で,97%の類似性の下で604のOTUSに分類した。全部で22の門,43の綱,82の目,142の科,204の属,244の種がアノテーションされた。それらの中で,門脈レベルでは,優占種(変形%),相対的豊富度(26%~34%),および放線菌(ACTINOBACTERIA%)(23%~32%)があった。綱レベルでは。主要な優占種は,プロテオバクテリア(ACTINOBACTERIA%)(相対的豊度23%~32%),酸綱(ACIDOBACTERIA%)(9%~11%),Α-プロテオバクテリア(10%)(10%~13%),Β-プロテオバクテリア(6%~8%)およびΓ-プロテオバクテリア(6%~12%)であった。科レベルでは。共 Ka氏菌科(NOCARDIOIDACEAE),COMAMONAS 胞菌科(COMAMONADACEAE),XANTHOMONAS 科(XANTHOMONADACEAE),鞘脂単 胞菌科(SPHINGOMONADACEAE),GEMMATIMONADETES 科(GEMMATIMONADACEAE)などがあった。属レベルでは,4つのサンプルの上位5つの優占種の中で,類諾Ka氏属とNOCARDIOIDES属は,優占種であった。コブノ指数,SHANNON指数,ACE指数,および菌糸指数は,それぞれ0.16-0.65,0.94-3.22,212-488,および210-490であった。【結語】イネ 幼虫幼虫の腸内細菌の多様性は豊富であり,個体群間の微生物群集構造と多様性は異なっていた。異なる数のサンプルデータと全体のデータは,コブノ個体群の腸内微生物の状態を包括的に反映することができた。本研究の結果は、コブノの微生物の機能及びその予防と治療における応用の更なる研究のために基礎を築いた。Data from the ScienceChina, LCAS. Translated by JST【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 類似性 ,  *細菌 ,  腸内微生物 ,  アノテーション ,  幼虫 ,  微生物 ,  菌糸 ,  個体群 ,  優占種
準シソーラス用語： 微生物群集構造 ,  プロテオバクテリア ,  種組成 ,  *群集構造 ,  腸内細菌 ,  *細菌群集構造 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： Cnaphalocrocis medinalis ,  intestine bacteria ,  diversity ,  16S rDNA ,  gene sequencing

分類 (3件)： 腸  (EJ06040N) ,  微生物生理一般  (EG03051L) ,  微生物に対する影響  (EE04020O)

タイトルに関連する用語 (2件)： 細菌群集構造 ,  多様性解析