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J-GLOBAL ID：201702235305393079   整理番号：17A0159099

ブタの体型に関連する遺伝子座の選択に関する研究【JST・京大機械翻訳】

Identifying Signatures of Selection Related to Small Body Size in Pigs

著者 (4件)： Li Wanbo (State Key Laboratory for Pig Genetic Improvement and Production Technology, Jiangxi Agricultural University) ,  Zhu Yaling (State Key Laboratory for Pig Genetic Improvement and Production Technology, Jiangxi Agricultural University) ,  Ai Huashui (State Key Laboratory for Pig Genetic Improvement and Production Technology, Jiangxi Agricultural University) ,  Guo Tianfu (State Key Laboratory for Pig Genetic Improvement and Production Technology, Jiangxi Agricultural University)
資料名： Xumu Shouyi Xuebao  (Xumu Shouyi Xuebao)
巻： 47  号： 10  ページ： 1977-1985  発行年： 2016年 
JST資料番号： C2231A  ISSN： 0366-6964  CODEN： CMHPAI  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： 中国 (CHN)  言語： 中国語 (ZH)

抄録/ポイント： 本研究の目的は,遺伝子型における中国のブタ品種の遺伝的分化を比較することによって,ゲノムのサイズに関連する遺伝子と可能な変異点を同定することができ,マウスの分子機構を解析することである。本研究では、小体型の指ととを用い、大体型の金華、二、河河を対照とし、全ゲノム配列に基づいてデータを測定した。2つの群の間の遺伝的分化係数(FST)とマウスのヘテロ接合性(HETEROZYGOSITY)を用いて,選択的信号を検出した。FST値が大きいがヘテロ接合性の小さい染色体セグメントは体型に関連する選択候補領域となる。これらの候補領域に含まれる遺伝子について遺伝子機能および経路のアノテーション解析,および突然変異部位の探索を行い,ブタ体型に関連する可能性のある選択された遺伝子および突然変異を明らかにしようとした。その結果,全ゲノム配列決定データをスクリーニングすることにより,32個の高品質のSNPSが得られ,40KBのスライディングウィンドウを用いてFSTとヘテロ接合性の計算を行った。FST値はZ変換(Z(FST))後5以上の領域が242個ある.ヘテロ接合性の最小値の200個の区間と242個のZ(FST)>5の区間の交差点をとり、13個の選択候補領域を確定し、その中に合計28個の遺伝子が含まれていることを確定した。PANTHERによる遺伝子アノテーションは,IGF1R,GUCY1A3などの機能候補遺伝子を含む17個の体型形質に関連する候補遺伝子を発見した。本研究では、ハイスループットシークエンシングデータに基づき、集団遺伝学的分析手段と結合し、体型サイズに関する選択領域を確定し、総合分析により、5とと型のブタの形成は非コード領域の一つあるいは複数の突然変異によるものと推測される。Data from the ScienceChina, LCAS. Translated by JST【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 遺伝子型 ,  ゲノム ,  集団遺伝 ,  アノテーション ,  *遺伝子 ,  品種 ,  突然変異 ,  変異 ,  *体格
準シソーラス用語： 候補遺伝子 ,  遺伝子機能 ,  ヘテロ接合性 ,  ゲノム配列 ,  分子機構 ,  遺伝的種分化 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： miniature pigs ,  whole-genome resequencing ,  signatures of selection ,  body size ,  candidate genes

分類 (1件)： 集団遺伝学  (EC01040J)

タイトルに関連する用語 (4件)： ブタ ,  体型 ,  遺伝子座 ,  研究