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J-GLOBAL ID：201702235955659740   整理番号：17A0532646

次元 質量 質量の組み合わせ分析に基づく赤痢菌プロテオミクスのプロテオミクス【JST・京大機械翻訳】

Proteogenomics analysis of Shigellaby combined multidimensional liquid chromatography tandem mass spectrometry

著者 (7件)： Zhao Lina (College of Life Sciences,North China University of Science and Technology) ,  Li Weiwei (College of Life Sciences,North China University of Science and Technology) ,  He Baoling (College of Life Sciences,North China University of Science and Technology) ,  Hu Fen (College of Life Sciences,North China University of Science and Technology) ,  Wang Yang (College of Life Sciences,North China University of Science and Technology) ,  Yu Yuan (College of Life Sciences,North China University of Science and Technology) ,  Gao Shuang (College of Life Sciences,North China University of Science and Technology)
資料名： Zhongguo Renshougonghuanbing Xuebao  (Zhongguo Renshougonghuanbing Xuebao)
巻： 32  号： 12  ページ： 1064-1069  発行年： 2016年 
JST資料番号： C2253A  ISSN： 1002-2694  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： 中国 (CHN)  言語： 中国語 (ZH)

抄録/ポイント： 【目的】次元 MMI.D(質量)のゲノムDNAアノテーションに基づくプロテオミクス法を用いて,フレキシナ 赤痢のゲノムアノテーションを改善する。【方法】赤痢2A301株(SF2A301)の全体蛋白質をトリプシンで消化し,MALDI-TOF/TOFとESI-MS/MSによって同定した。質量スペクトルデータはそれぞれMASCOTとSEQUESTソフトウェアを用いてSF2A301の全ゲノムに基づいて構築した6つのリーディングデータベースを検索し、原基因組の注釈の検証と補充を完成した。結果は,次元 質量 質量の組合せシステムが同定蛋白質の被覆率を増加させ,SF2A301の1個の蛋白質コード遺伝子産物を同定し,COGSデータベースの22個の機能的分類群9つの未注釈の遺伝子を発見し,RT-PCRとNORTHERN BLOTのさらなる検証を得た。新規遺伝子の多くは重複遺伝子であり,3つの入れ子遺伝子を含んでいる。【結論】単一タンデム質量分析法と比較して,多重タンデム質量分析法は,赤痢菌のゲノムアノテーションをより効果的に検証することができ,そして,更新後の遺伝子組み換えは,今後の赤痢菌の機能Data from the ScienceChina, LCAS. Translated by JST【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： RT-PCR法 ,  ゲノム ,  データベース ,  *赤痢菌 ,  *赤痢 ,  質量スペクトル ,  *プロテオミクス ,  タンデム質量分析 ,  被覆率 ,  遺伝子 ,  アノテーション ,  トリプシン
準シソーラス用語： 遺伝子組換 ,  遺伝子産物 ,  ESI-MS/MS , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： Shigella flexneri ,  MALDI ,  ESI ,  proteogenomics ,  genome annotation

分類 (2件)： 蛋白質・ペプチド一般  (EB03010N) ,  有機化合物の各種分析  (CC08034J)

タイトルに関連する用語 (6件)： 次元 ,  質量 ,  組み合わせ ,  分析 ,  赤痢菌 ,  プロテオミクス