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J-GLOBAL ID：201702240381635131   整理番号：17A0073884

新疆フタ抗体ファージディスプレイライブラリーの多様性のバイオインフォマティクス解析【JST・京大機械翻訳】

Analysis of the Diversity of VHH Library from Bactrian Camel (Camelus bactrianus) with Bioinformatics

著者 (4件)： Feng Yaning (College of Life Science and Technology, Xinjiang University) ,  Jiang Zhiqiang (No. 104 Agricultural and Animal Husbandry Regimental Farm of No. 12 Agricultural Production Division of Xinjiang Production and Construction Corps) ,  Ma Xiaoling (College of Life Science and Technology, Xinjiang University) ,  Li Jiangwei (College of Life Science and Technology, Xinjiang University)
資料名： Xinjiang Nongye Kexue  (Xinjiang Nongye Kexue)
巻： 53  号： 8  ページ： 1533-1538  発行年： 2016年 
JST資料番号： C3029A  ISSN： 1001-4330  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： 中国 (CHN)  言語： 中国語 (ZH)

抄録/ポイント： [目的]ラクダの免疫系には重鎖抗体のみが存在し、その可変領域のWHH断片は最も小さい天然抗体断片である。フタ遺伝子の配列解析により,二重遺伝子の特徴を調べ,VHHライブラリーの多様性を分析した。【方法】すべての抗体遺伝子フラグメントを,新疆 VHHの特異的プライマーを用いて増幅し,M13ファージミドベクターに連結し,ファージディスプレイライブラリーを構築するために,PIII蛋白質と融合させた。遺伝子配列決定とコロニーPCR法により,ライブラリーサイズと陽性クローン挿入率を分析した。NCBI--ツールは抗体配列に対してIMGT番号の命名を行い、ツールツールは抗体の保存配列の分布頻度を分析し、MEGA6ソフトウェアはVHH配列に対して相同性比較と系統樹の構築を行った。【結果】免疫化された新疆のリンパ球を用いて,1.4×109の容量のファージ抗体ライブラリーを構築した。91のランダム選択したライブラリーTG1コロニーをPCRにより増幅した。結果は,ライブラリーの陽性率が97%であり,DNA配列決定の結果,ライブラリーの多様性が97.8%であることを示した。91個のクローンDNA配列の分析結果により、これらの遺伝子のうち2つは通常のVH抗体以外に、残りは重鎖の抗VHH抗体であることが明らかになった。抗体配列中の特徴アミノ酸の分布により,91個の抗体配列を7つの亜群に分割した。【結論】新疆のフタ VHHのライブラリーは多様性が高く,生物情報学的分析はライブラリーにおける多様性クローンの分布と特性を明らかにし,新疆のファージディスプレイライブラリーの更なる構築に役立つ。Data from the ScienceChina, LCAS. Translated by JST【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 相同性 ,  重鎖 ,  *バクテリオファージ ,  免疫グロブリン遺伝子 ,  アミノ酸 ,  系統樹 ,  PCR法 ,  *新疆ウイグル自治区 ,  ラクダ ,  クローン ,  *抗体
準シソーラス用語： DNA配列 ,  遺伝子配列 ,  *バイオインフォマティクス ,  *ファージディスプレイライブラリー , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： Bactrian camel ,  nanobody ,  phage display library ,  VHH sequence ,  bioinformatics analysis

分類 (2件)： バイオアッセイ  (EA03060N) ,  抗原・抗体・補体の生化学  (ED04020L)

タイトルに関連する用語 (5件)： 新疆 ,  抗体 ,  ファージディスプレイライブラリー ,  多様性 ,  バイオインフォマティクス解析