尿中の修飾ヌクレオシドを同定するための詳細な鉱山UPLC Q TOF/MSデータに相補的な技術としてのUHPLC Q Trap/MSを用いた【Powered by NICT】

Lu Zhiwei; Wang Qing; Wang Meiling; Fu Shuang; Zhang Qingqing; Zhang Zhixin; Zhao Huizhen; Liu Yuehong; Huang Zhenhai; Xie Ziye; Yu Honghong; Gao Xiaoyan

文献

J-GLOBAL ID：201702241354345325 整理番号：17A0754773

尿中の修飾ヌクレオシドを同定するための詳細な鉱山UPLC Q TOF/MSデータに相補的な技術としてのUHPLC Q Trap/MSを用いた【Powered by NICT】

Using UHPLC Q-Trap/MS as a complementary technique to in-depth mine UPLC Q-TOF/MS data for identifying modified nucleosides in urine

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資料名：
巻： 1051 ページ： 108-117 発行年： 2017年
JST資料番号： W0571A ISSN： 1570-0232 資料種別：逐次刊行物 (A)
記事区分：原著論文発行国：オランダ (NLD) 言語：英語 (EN)

RNAの代謝産物,修飾ヌクレオシドは形態異常の出現前に癌の潜在的バイオマーカーである。癌バイオマーカー発見のためのヒト尿中のヌクレオシドの検出と同定の包括的に非常に重要である。しかし,低豊度,大きな極性とマトリックス効果は,尿中ヌクレオシドの検出を困難にしている。本論文では,更なる同定と検証を紹介した統合法は,試料調製とそれに続く超高速液体クロマトグラフィー-4重極飛行時間型質量分析(UPLC Q TOF/MS)検出と一次同定により,ハイブリッド3連4重極線形イオントラップ質量分析計(UHPLC Q Trap/MS)と組み合わせた超高性能液体クロマトグラフィーから成っていた。,ヌクレオシドを濃縮し,尿マトリックス効果を除去するために,固相抽出(SPE)と溶出条件の異なる収着剤材料をスクリーニングした。UPLCQ-TOF/MSを用いて,MS~Eモードでの質量データを取得した。尿試料中のヌクレオシドの構造式は主に社内データベースとオンラインデータベースからの保持時間,正確な質量前駆体イオンおよびフラグメントイオンによって同定した。第三に,特徴的フラグメントイオンを欠く予備同定ヌクレオシド構造は,多重反応モニタリングトリガ増強プロダクトイオンスキャン(MRM EPI)と中性損失スキャン(NL)のUHPLC Q Trap/MSにより検証した。最後に,フェニルボロン酸(PBA)をベースにしたSPEは最適抽出条件下での高いMSシグナルと弱いマトリックス効果のために利用した。五十五ヌクレオシドは主にUPLCQ-TOF/MS,そのうち50ヌクレオシドは,UHPLC Q Trap/MSにより確認したにより同定した。五種のヌクレオシド,すなわち4′,5′-ジデヒドロ-5′-デオキシアデノシン,4′,5′-ジデヒドロ-5′-デオキシイノシン,イソニコチンアミドリボシド,peroxywybutosineとhydroxywybutosine,尿から初めて見出された。結果はヒトメタボロームデータベース(HMDB)を拡大する。Copyright 2017 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【Powered by NICT】

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有機化合物の各種分析

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