EST-SSRマーカーの開発とプライマーのスクリーニングを行った。【JST・京大機械翻訳】

Wang Qielu; Liu Yi; Song Hongmei; Wang Xuejie; Liu Chao; Mu Xidong; Hu Yinchang; Luo Jianren

文献

J-GLOBAL ID：201702242928791345 整理番号：17A0345639

EST-SSRマーカーの開発とプライマーのスクリーニングを行った。【JST・京大機械翻訳】

Development and primer selection of EST-SSR molecular markers based on transcriptome sequencing of Osteoglossum bicirrhosum

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資料名：
巻： 46 号： 6 ページ： 8-13 発行年： 2016年
JST資料番号： C2668A ISSN： 1000-6907 資料種別：逐次刊行物 (A)
記事区分：原著論文発行国：中国 (CHN) 言語：中国語 (ZH)

MISAソフトウェアを用いて,二重(BICIRRHOSUM BICIRRHOSUM)の生殖腺の配列決定により得られた188個のUNIGENE遺伝子座をSSRにより検出した。【結果】SSR遺伝子座は11の遺伝子座で検出され,2つ以上のSSR遺伝子座を含む合計UNIGENEの遺伝子座を含んでいた。SSRの発生頻度は6.32%であり,平均距離は9BPであった。選別されたSSR遺伝子座の中で、優性反復ヌクレオチドはトリヌクレオチド、トリヌクレオチドと四ヌクレオチドであり、その中のジヌクレオチド反復モチーフの数量は最も多く、総数の50.52%を占める。全部で216の反復モチーフがあり,その中で最も多くのタイプのヌクレオチドは重複%を占め,総数の%%を占めた。全部でスクリーニングしたSSR遺伝子座からランダムに50個の遺伝子座を選び、プライマー PREMIER 5.0を用いてプライマーを設計し、25ペアのプライマーを用いて、特異的な産物を増幅することができた。また,いずれも科科の美しい(魚 FORMOSUS)の3亜種に共通している。結果により、トランスクリプトームシークエンシングにより産生されたEST配列はSSRマーカーを開発する有効なソースであり、得られたEST-SSRプライマーは二重とその近縁種の遺伝分析、遺伝図鑑の構築及び分子マーカー補助育種などの作業に用いることができることが分かった。Data from the ScienceChina, LCAS. Translated by JST【JST・京大機械翻訳】

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著者キーワード (3件)： , ,

遺伝子の構造と化学 , 分子遺伝学一般 , 作物の品種

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