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J-GLOBAL ID：201702246197287549   整理番号：17A0202283

融合蛋白質複合体のヒト蛋白質相互作用ネットワーク機能モジュール発見【JST・京大機械翻訳】

The functional module detection of PPI network by incorporating protein complex data

著者 (6件)： Liu Guangming (School of Computer and Information Technology, Beijing Jiaotong University) ,  Yang Liu (School of Computer and Information Technology, Beijing Jiaotong University) ,  Gao Panpan (School of Computer and Information Technology, Beijing Jiaotong University) ,  Wang Bangjun (School of Computer and Information Technology, Beijing Jiaotong University) ,  Zhou Xuezhong (School of Computer and Information Technology, Beijing Jiaotong University) ,  Yu Jian (School of Computer and Information Technology, Beijing Jiaotong University)
資料名： Zhineng Xitong Xuebao  (Zhineng Xitong Xuebao)
巻： 11  号： 5  ページ： 703-710  発行年： 2016年 
JST資料番号： C2755A  ISSN： 1673-4785  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： 中国 (CHN)  言語： 中国語 (ZH)

抄録/ポイント： 人間の蛋白質相互作用ネットワークにおける機能モジュールの検出は,現在のネットワーク医学研究のホットな話題である。良い機能モジュールは,蛋白質の相互作用の分子機構を理解し,認識するのに役立つ。近年のいくつかの研究は,複合ネットワークにおけるトポロジーモジュール発見アルゴリズムに基づく蛋白質相互作用ネットワークのモジュール分割を行い,そして,それらの生物学的機能を研究した。PPIネットワークにおける蛋白質間相互作用のデータ獲得の不完全性のため、関連研究により、現在人類はヒトタンパク質間の相互作用データの10%~20%しか得られず、その中にすでに得られたデータにはいくつかのノイズが含まれていることが明らかになっている。これはトポロジー構造に基づくコミュニティ検出アルゴリズムの精度を低下させる。この問題を克服するために,本論文では,蛋白質複合体データをモジュール検出アルゴリズムに統合し,K-平均とNMFアルゴリズムを用いてPPIネットワークをモジュール分割し,次に遺伝子オントロジーと経路の2つの側面から検出したモジュールを分析した。実験結果は,蛋白質複合体を融合したPPIネットワークが,生物学的意義を持つ機能モジュールを容易に得ることができることを示した。Data from the ScienceChina, LCAS. Translated by JST【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 不整 ,  *タンパク質複合体 ,  アルゴリズム ,  *ヒト ,  位相幾何学 ,  *タンパク質 ,  データ収集 ,  *ネットワーク ,  コミュニティ ,  *相互作用
準シソーラス用語： 遺伝子オントロジー ,  検出アルゴリズム ,  分子機構 ,  医学研究 ,  *蛋白質間相互作用 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (6件)： PPI ,  protein complex ,  functional module ,  module detection ,  gene ontology ,  pathway

分類 (1件)： 分子・遺伝情報処理  (JE15040B)

タイトルに関連する用語 (6件)： 融合 ,  蛋白質複合体 ,  ヒト ,  蛋白質相互作用 ,  モジュール ,  発見