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J-GLOBAL ID：201702247049437503   整理番号：17A0109860

上海白ブタ(上系)の遺伝的多様性と集団構造解析【JST・京大機械翻訳】

Genetic Diversity and Population Structure Analysis of Shanghai White Pig (Sus scrofa)

著者 (6件)： Sheng Zhonghua (College of Animal Science and Technology,Yangzhou University) ,  Zhang Zhe (School of Agriculture and Biology,Shanghai Jiao Tong University) ,  Xiao Qian (School of Agriculture and Biology,Shanghai Jiao Tong University) ,  Wang Qishan (School of Agriculture and Biology,Shanghai Jiao Tong University) ,  Chen Guohong (College of Animal Science and Technology,Yangzhou University) ,  Pan Yuchun (School of Agriculture and Biology,Shanghai Jiao Tong University)
資料名： Nongye Shengwu Jishu Xuebao  (Nongye Shengwu Jishu Xuebao)
巻： 24  号： 9  ページ： 1293-1301  発行年： 2016年 
JST資料番号： C2715A  ISSN： 1674-7968  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： 中国 (CHN)  言語： 中国語 (ZH)

抄録/ポイント： 上海白豚(上系)(SUS SCROFA)は上海市Min行区市の地方栽培品種であり、近年、品種の衝撃を導入することにより、その各生産指標が深刻に衰退し、しかもその遺伝資源特性、遺伝基礎及び交雑性能などについての理解が欠けている。本研究は全ゲノム範囲内の遺伝標識を応用し、上海白豚(上系)の個体群に対して遺伝的多様性と集団構造の分析を行った。まず、個体群内の遺伝的多様性を反映する3つの重要な指標-対立遺伝子の豊度(ALLELIC RICHNESS、A_R)、マーカー多型の割合(PID OF POLYMORPHIC MARKERS,P_N)と期待ヘテロ接合性(EXPECTED HETEROZYGOSITY,H_E)について分析と計算を行った。その結果,上海の白ブタ(上系)は遺伝的多様性が最も高く(P_N=0.731,A_R=放,H_E=0.221)であることを示した。上海の白ブタ(上系)と太湖品種間の遺伝的分化度(0.237±0.007)は,それらの遺伝的分化度(0.219±0.008)よりも大きかった。また,主成分分析(PRINCIPAL COMPONENTS ANALYSIS, PCA),STRUCTUREと系統樹などを用いて集団構造を解析した。結果により、上海白豚(上系)の個体群内の遺伝的多様性は、太湖のブタと西洋のブタより高いことが分かった。個体群間の遺伝的距離は,上海のブタ(上系%)が太湖のそれよりも西側のブタに近いことを示した。主成分分析,クラスタ分析および集団構造解析により,上海白ブタ(上系)が独立したグループを形成できることを示した。以上の結果から,分子レベルで見ると,上海白ブタ(上系)は独立した育成品種として合理的であり,特にその独特の遺伝構造を持ち,さらにその保護,開発と利用を強化すべきである。Data from the ScienceChina, LCAS. Translated by JST【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 個体群 ,  品種 ,  対立遺伝子 ,  遺伝資源 ,  主成分分析 ,  栽培品種 ,  クラスタ分析 ,  *遺伝 ,  系統樹
準シソーラス用語： 遺伝的構造 ,  遺伝距離 ,  *集団構造 ,  遺伝子マーカ ,  *遺伝多様性 ,  *上海市 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (4件)： Shanghai white pig ,  Pig genome ,  Genetic distance ,  Population structure

分類 (2件)： 遺伝子の構造と化学  (EC02020U) ,  作物の品種  (FC02020V)

タイトルに関連する用語 (6件)： 上海 ,  白 ,  ブタ ,  遺伝的多様性 ,  集団 ,  構造解析