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J-GLOBAL ID：201702247865057398   整理番号：17A0109776

本稿では,ITRAQ スペクトル L.の根における塩ストレス応答の差次的発現蛋白質を,質量スペクトル分析によりスクリーニングした。【JST・京大機械翻訳】

Screening Differentially Expressed Proteins in Southern Type Alfalfa (Medicago sativa ’Millenium’) Root upon Salt Stress by iTRAQ Protein Mass Spectrometry

著者 (4件)： Ma Jin (School of Landscape Architecture, Zhejiang Agriculture and Forestry university) ,  Zheng Gang (School of Landscape Architecture, Zhejiang Agriculture and Forestry university) ,  Pei Cuiming (School of Landscape Architecture, Zhejiang Agriculture and Forestry university) ,  Zhang Zhenya (School of Landscape Architecture, Zhejiang Agriculture and Forestry university)
資料名： Nongye Shengwu Jishu Xuebao  (Nongye Shengwu Jishu Xuebao)
巻： 24  号： 4  ページ： 497-509  発行年： 2016年 
JST資料番号： C2715A  ISSN： 1674-7968  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： 中国 (CHN)  言語： 中国語 (ZH)

抄録/ポイント： 本研究では,蛋白質レベルにおける南部(MEDICAGO SATIVA’’MILLENNIUM’)の塩ストレスに対する分子機構を明らかにするために,30日齢の齢 南部実生を材料として使用した。72時間の正常培養と250MMOL/LのNACLで処理した根の蛋白質発現を分析した。同位体相対標識と絶対定量技術(ISOBARIC TAGS FOR RELATIVE AND ABSOLUTE QUANTITATION, ITRAQ)を用いて、二次元液体クロマトグラフィーとタンデム質量分析(2-DIMENSIONAL LIQUID CHROMATOGRAPHY-TANDEM MASS SPECTROMETRY,2D-LC-MS/MS)の定量的タンパク質技術を用いて、南方の型紫花根部の塩ストレス応答差異タンパク質を同定した。得られた差異蛋白質についてバイオインフォマティクス解析を行い,潜在的標的蛋白質をスクリーニングした。同時に,5つの差次的発現蛋白質を選択し,リアルタイム蛍光定量的PCR(QRT-PCR)によって確認した。その結果,3種の定量的蛋白質が同定され,534種の差次的蛋白質(変動係数≧1.2,P<0.05)があり,そのうちの281種がアップレギュレーションされ,253種が下方制御された。遺伝子オントロジー(GENE ONTOLOGY,GO)の分子機能はこれらの差異性タンパク質が主に輸送活性、触媒活性と酵素調節活性に参与することを提示した。京都遺伝子とゲノムシソーラス(KYOTO ENCYCLOPEDIA OF GENES AND GENOMES, KEGG)経路は代謝経路、二次代謝産物の生合成、フェニルアラニン代謝とリボソームなど(P<0.05、誤り発見率(FALSE ミクスドシグナルテスタ RATE,FDR)<0.05)に顕著に濃縮される。同定に成功した差次的蛋白質は,シグナル伝達(%),酸化防止剤(7.68),防御(5.61),蛋白質合成,加工と分解(%),エネルギー産生と輸送(5.81),膜と細胞内輸送(5.62),細胞構造,分裂と細胞骨格(2.06)などに関与する。差次的発現蛋白質は,シグナル伝達,抗酸化物質および防御に関連する蛋白質発現を上方制御し,代謝およびエネルギー産生および輸送関連蛋白質発現を減少させた。QRT-PCRの結果は,MRNAと蛋白質の発現レベルが一致しないことを示した。研究により、ヒスチジンリン酸転移タンパク質、マイトジェン活性化プロテインキナーゼ、H型チオレドキシン、メチオニンスルホキシド還元酵素遺伝子、鳥Gan二リン酸(( DIPHOSPHATE, GDP)解離抑制因子、脂質転移タンパク質、Β-1が発見された。2-キシロースおよびH2/2/3/H4コア蛋白質は,アルファルファの耐塩性の潜在的標的蛋白質である可能性がある。本研究では、ITRAQと2D-LC-MS/MS技術を併用し、南方の型紫花の根部における塩ストレスの差異発現タンパク質を効果的に選別し、紫花苜蓿塩のストレス応答の分子調節メカニズムを深く認識するために、基礎を築いた。Data from the ScienceChina, LCAS. Translated by JST【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： リン酸 ,  実生 ,  *タンパク質 ,  MAPキナーゼ ,  酸化防止剤 ,  代謝経路 ,  アップレギュレーション ,  タンデム質量分析 ,  細胞内輸送 ,  二次代謝産物 ,  ダウンレギュレーション ,  蛋白質発現 ,  *塩分ストレス ,  *ストレス応答 ,  液体クロマトグラフィー-タンデム質量分析
準シソーラス用語： LC/MS/MS , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (4件)： Alfalfa ,  Salt stress ,  Differentially expressed protein ,  Isobaric tags for relative and absolute quantitation (iTRAQ)

分類 (2件)： 液体クロマトグラフィー  (CC04014L) ,  有機化合物の各種分析  (CC08034J)

タイトルに関連する用語 (9件)： iTRAQ ,  スペクトル ,  根 ,  塩 ,  ストレス応答 ,  差次的発現 ,  蛋白質 ,  質量スペクトル分析 ,  スクリーニング