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J-GLOBAL ID：201702248823121403   整理番号：17A0450922

低温貯蔵中のサツマイモ塊根のトランスクリプトームプロファイリング【Powered by NICT】

Transcriptome profiling of sweetpotato tuberous roots during low temperature storage

著者 (10件)： Ji Chang Yoon (Plant Systems Engineering Research Center, Korea Research Institute of Bioscience and Biotechnology (KRIBB), 125 Gwahak-ro, Daejeon, 34141, South Korea) ,  Ji Chang Yoon (Department of Green Chemistry and Environmental Biotechnology, Korea University of Science and Technology (UST), 217 Gajeong-ro, Daejeon, 34113, South Korea) ,  Chung Won-Hyong (Division of Nutrition and Metabolism Research, Korea Food Research Institute, 1201-62 Anyangpangyo-ro, Sungnam-Si, 13539, South Korea) ,  Kim Ho Soo (Plant Systems Engineering Research Center, Korea Research Institute of Bioscience and Biotechnology (KRIBB), 125 Gwahak-ro, Daejeon, 34141, South Korea) ,  Jung Won Yong (Plant Systems Engineering Research Center, Korea Research Institute of Bioscience and Biotechnology (KRIBB), 125 Gwahak-ro, Daejeon, 34141, South Korea) ,  Kang Le (Plant Systems Engineering Research Center, Korea Research Institute of Bioscience and Biotechnology (KRIBB), 125 Gwahak-ro, Daejeon, 34141, South Korea) ,  Kang Le (Department of Green Chemistry and Environmental Biotechnology, Korea University of Science and Technology (UST), 217 Gajeong-ro, Daejeon, 34113, South Korea) ,  Jeong Jae Cheol (Plant Systems Engineering Research Center, Korea Research Institute of Bioscience and Biotechnology (KRIBB), 125 Gwahak-ro, Daejeon, 34141, South Korea) ,  Kwak Sang-Soo (Plant Systems Engineering Research Center, Korea Research Institute of Bioscience and Biotechnology (KRIBB), 125 Gwahak-ro, Daejeon, 34141, South Korea) ,  Kwak Sang-Soo (Department of Green Chemistry and Environmental Biotechnology, Korea University of Science and Technology (UST), 217 Gajeong-ro, Daejeon, 34113, South Korea)
資料名： Plant Physiology and Biochemistry  (Plant Physiology and Biochemistry)
巻： 112  ページ： 97-108  発行年： 2017年 
JST資料番号： W1643A  ISSN： 0981-9428  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： フランス (FRA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： サツマイモ[Ipomoea batatas(L.)Lam]は,高い工業的価値をもつ世界的に重要な根菜作物である。しかし,サツマイモ塊根は10°C以下の温度でそれらの品質にマイナスの影響を与える低温損傷を受けるため,冬季の収穫後損傷は工業化のための主要な制約条件である。収穫後低温貯蔵時の寒冷傷害応答を理解するために,著者らは6週間の最適(13 °C)または低温(4 °C)で貯蔵した塊根のトランスクリプトームを解析した包括的次世代シーケンシング技術を用いた。九c DNAライブラリーから,298,765,564クリーン読み取り,1100bpの平均長をもつ58,392種の遺伝子(unigene)にde novo集合したを生成した。全3216差次的発現遺伝子(DEG)を検出と分類六クラスタ,クラスタ2 4と5(1464 DEGs)は低温度下でアップレギュレートした。これら三クラスタにおける遺伝子は,不飽和脂肪酸,病原体防御,及びフェニルアラニン代謝の生合成に関与している。対照的に,一般的に低温でダウンレギュレーションされた,クラスタ1 3および6(1752 DEGs)の遺伝子は抗酸化酵素をコードするか,グリセロリン脂質,炭水化物,またはエネルギー代謝に関与している。を定量的RT-PCRによるトランスクリプトーム解析の結果を確認した。我々のトランスクリプトーム分析は低温貯蔵中の低温障害の包括的機構の理解を前進させ,サツマイモ塊根の収穫後貯蔵の改善を容易にするであろう。Copyright 2017 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【Powered by NICT】

シソーラス用語： DNA【核酸】 ,  不飽和脂肪酸 ,  *塊根 ,  *低温 ,  冬 ,  *冷蔵 ,  *トランスクリプトーム ,  ダウンレギュレーション ,  クラスタ ,  *サツマイモ ,  RT-PCR法 ,  アミノ酸 ,  芳香族化合物 ,  第一アミン
準シソーラス用語： トランスクリプトーム解析 ,  抗酸化酵素 ,  低温障害 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： 低温障害 ,  差次的に発現した遺伝子 ,  低温貯蔵 ,  サツマイモ ,  トランスクリプトーム

分類 (2件)： 植物の生化学  (EH01050J) ,  いも類  (FC03036L)

物質索引 (1件)： フェニルアラニン

タイトルに関連する用語 (3件)： 低温貯蔵 ,  サツマイモ ,  塊根