三 蟹腸の腸内フローラの構造と代謝表現型の分析【JST・京大機械翻訳】

Zeng Tinglan; Ye Yangfang; Mu Changkao; Wang Kai; Li Ronghua; Wang Chunlin

文献

J-GLOBAL ID：201702250645061204 整理番号：17A0353657

三蟹腸の腸内フローラの構造と代謝表現型の分析【JST・京大機械翻訳】

Gut Microbiota and Metabolic Phenotype of Portunus trituberculatus

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巻： 44 号： 12 ページ： 1867-1873 発行年： 2016年
JST資料番号： C2394A ISSN： 0253-3820 CODEN： FHHHDT 資料種別：逐次刊行物 (A)
記事区分：原著論文発行国：中国 (CHN) 言語：中国語 (ZH)

16S RRNA遺伝子のハイスループット配列決定と核磁気共鳴(NMR)に基づくメタボロミクス技術を用いて,三内の腸内フローラの構造と代謝物組成を分析する方法を確立した。ゲノムDNAと16S RRNA遺伝子のV3-V4可変領域を増幅し,MISEQの配列決定に用いた。対測序の結果によるクラスター分析とアノテーション分析により、ガザミ科の細菌群集構造は変形菌杆菌門、門、,、,と酸桿菌門を主とし、その中で発光菌、,と歩属菌の細菌豊度が最も高いことが分かった。ガザミ試料を組織破砕,メタノール-水(2:1,V/V)抽出,高速遠心及び凍結乾燥後,NaJiaLin酸緩衝液中に懸濁し,NMR分析に用いた。標準のNOESYPR1Dパルス列を用いて1H NMRスペクトルを収集し、90°のパルス幅が約10ΜS、待ち時間が2S、混合時間が100MS、幅が20PPM、サンプリング点数が32Kである。自由誘導減衰の累積回数は64である。2D NMR譜対腸道代謝物を用いて帰属し,アミノ酸,有機カルボン酸および有機アミン類を含む30種の代謝産物を得た。本方法は,ガザミ内の腸内フローラとその代謝物の系統的分析に用いることができる。Data from the ScienceChina, LCAS. Translated by JST【JST・京大機械翻訳】

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遺伝学研究法 , 微生物の生態

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三 蟹腸の腸内フローラの構造と代謝表現型の分析【JST・京大機械翻訳】

三蟹腸の腸内フローラの構造と代謝表現型の分析【JST・京大機械翻訳】