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J-GLOBAL ID：201702254305871380   整理番号：17A0318206

メタゲノム断片動員により決定した中温tunisiensis L3,好熱性バイオガスプラントにおける重要な加水分解細菌とその存在量のゲノム特性化【Powered by NICT】

Genomic characterization of Defluviitoga tunisiensis L3, a key hydrolytic bacterium in a thermophilic biogas plant and its abundance as determined by metagenome fragment recruitment

著者 (13件)： Maus Irena (Center for Biotechnology, Bielefeld University, 33615 Bielefeld, Germany) ,  Cibis Katharina Gabriela (Institute of Microbiology and Wine Research, Johannes Gutenberg University Mainz, 55122 Mainz, Germany) ,  Bremges Andreas (Center for Biotechnology, Bielefeld University, 33615 Bielefeld, Germany) ,  Bremges Andreas (Faculty of Technology, Bielefeld University, 33615 Bielefeld, Germany) ,  Stolze Yvonne (Center for Biotechnology, Bielefeld University, 33615 Bielefeld, Germany) ,  Wibberg Daniel (Center for Biotechnology, Bielefeld University, 33615 Bielefeld, Germany) ,  Tomazetto Geizecler (Center for Biotechnology, Bielefeld University, 33615 Bielefeld, Germany) ,  Blom Jochen (Department of Bioinformatics and Systems Biology, Justus-Liebig-University Giessen, 35390 Giessen, Germany) ,  Sczyrba Alexander (Center for Biotechnology, Bielefeld University, 33615 Bielefeld, Germany) ,  Sczyrba Alexander (Faculty of Technology, Bielefeld University, 33615 Bielefeld, Germany) ,  Konig Helmut (Institute of Microbiology and Wine Research, Johannes Gutenberg University Mainz, 55122 Mainz, Germany) ,  Puehler Alfred (Center for Biotechnology, Bielefeld University, 33615 Bielefeld, Germany) ,  Schlueter Andreas (Center for Biotechnology, Bielefeld University, 33615 Bielefeld, Germany)
資料名： Journal of Biotechnology  (Journal of Biotechnology)
巻： 232  ページ： 50-60  発行年： 2016年 
JST資料番号： A0456C  ISSN： 0168-1656  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 好熱性バイオガス製造プラントから発生するDefluviitoga tunisiensis L3のゲノム配列を確立し,最近著者らのグループによるゲノム発表として発表された。D.tunisiensis L3の環状染色体は2,053,097bpのサイズと31.38%の平均GC含量を有していた。D.tunisiensis L3ゲノム配列をより詳細に解析するために,共有コア遺伝子に基づく完全に配列決定されたThermotogae株の系統学的解析を行った。,北海石油生産井戸から単離したPetrotoga mobilis DSM10674~TはD.tunisiensis L3の最も近縁であった。P.mobilis DSM10674~TとD.tunisiensis L3の比較ゲノム解析は,オーソロガス遺伝子の発生に関する中程度の類似性を示した。両ゲノムは1351コア遺伝子の共通セットを共有している。バイオガス生産プロセスのための重要な代謝経路の再構成は,D.tunisiensis L3ゲノムは,セルロース,キチン,キシランを含むさまざまな複合多糖類の利用を容易にするための予測遺伝子の大規模なセットをコードすることを明らかにした。エタノール,酢酸,水素(H_2)および二酸化炭素(CO_2)は発酵プロセスの可能な最終産物であることが分かった。後者の三種の代謝物がメタン生成古細菌の基質,嫌気性消化プロセスの最終段階に重要な有機体を表現していると考えられている。D.tunisiensis L3間の関連性と好熱性バイオガス製造プラント内の支配的なバイオガスコミュニティメンバーの程度を決定するために,対応する微生物群集から得られたメタゲノム配列はL3ゲノム配列上にマッピングした。フラグメント動員はD.tunisiensis L3ゲノムは高いマッチング精度を特徴とするメタゲノム配列で覆われたほぼ完全にことを明らかにした。この結果は,高度に関連したまたは参照株と同一もD.tunisiensis L3株は,好熱性バイオガス製造プラントのコミュニティ内で支配的な役割を果たすことを示した。Copyright 2017 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【Powered by NICT】

シソーラス用語： セルロース ,  *好熱性 ,  二酸化炭素 ,  類似性 ,  *ゲノム ,  基質 ,  代謝経路 ,  *キャラクタリゼーション ,  嫌気性処理 ,  代謝産物 ,  脂肪酸 ,  薬物 ,  脂肪族アルコール
準シソーラス用語： ゲノム配列 ,  バイオガス生産 ,  *メタゲノム , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (4件)： 好熱性細菌 ,  Thermotogae ,  糖利用 ,  ゲノム比較は解析

分類 (1件)： 遺伝子の構造と化学  (EC02020U)

物質索引 (2件)： 酢酸 ,  エタノール

タイトルに関連する用語 (9件)： メタゲノム ,  断片 ,  中温 ,  好熱性 ,  バイオガスプラント ,  加水分解 ,  細菌 ,  ゲノム ,  特性化