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J-GLOBAL ID：201702256296872217   整理番号：17A0750267

底生シアノバクテリアからのDNA抽出:比較評価と最適化【Powered by NICT】

DNA extraction from benthic Cyanobacteria: comparative assessment and optimization

著者 (6件)： Gaget V. (Ecology and Environmental Sciences, School of Biological Sciences, University of Adelaide, Adelaide, SA, Australia) ,  Keulen A. (Ecology and Environmental Sciences, School of Biological Sciences, University of Adelaide, Adelaide, SA, Australia) ,  Lau M. (Australian Water Quality Centre, South Australia Water Corporation, Adelaide, SA, Australia) ,  Monis P. (Ecology and Environmental Sciences, School of Biological Sciences, University of Adelaide, Adelaide, SA, Australia) ,  Monis P. (Australian Water Quality Centre, South Australia Water Corporation, Adelaide, SA, Australia) ,  Brookes J.D. (Ecology and Environmental Sciences, School of Biological Sciences, University of Adelaide, Adelaide, SA, Australia)
資料名： Journal of Applied Microbiology  (Journal of Applied Microbiology)
巻： 122  号： 1  ページ： 294-304  発行年： 2017年 
JST資料番号： A0635A  ISSN： 1364-5072  CODEN： JAMIFK  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 目的:底生シアノバクテリアは,これらの浮遊性対応物と類似した毒性と臭気化合物を生成し,飲料水供給の品質は挑戦的である。底生藻類及び他の微生物が産生する生物膜は複雑で保護マトリックスである。,シアノバクテリアの豊度と同定を決定するためのモニタリングは,分子技術に依存している,DNA単離法は,臨界の選択であった。底生シアノバクテリアのPCRに基づく分析のための最良のDNA収率を保証するために本研究は,DNA抽出法をDNA回収のための最適を調べた。【方法】と結果従来のフェノール-クロロホルム抽出法は,五種類の市販キットと比較して,試験された化学的及び物理的細胞溶解段階の添加であった。種々の方法の有効性は,UV分光光度法とシアノバクテリア特異的プライマーを用いた定量的PCR(qPCR)によるDNAの量と質を測定することにより評価した。市販キットで回収されたDNAの収率と品質は,フェノール-クロロホルムプロトコルで得られたDNAのそれよりも有意に高かった。物理的細胞溶解段階を含む【結論】キット,MO BIO電力土壌とバイオフィルムキットのような底生シアノバクテリアからのDNA単離のための最も効率的であった。研究の意義と影響:これらの市販キットは大きな回復とDNA抽出のための危険な化学物質の除去を可能にし,底生マットからのDNAの単離のための選択法となっている。も底生シアノバクテリアからのDNAの抽出,次世代シーケンシングを用いたqPCRsまたは個体群組成分析を用いた環境研究におけるシアノバクテリアの特性化を改良するのを助けることができるを容易にする。Copyright 2017 Wiley Publishing Japan K.K. All Rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【Powered by NICT】

シソーラス用語： 生物膜 ,  *最適化 ,  *抽出 ,  品質 ,  *藍藻類 ,  *DNA【核酸】 ,  個体群 ,  化学物質 ,  単離 ,  毒性 ,  吸光分光分析 ,  キャラクタリゼーション ,  定量的PCR法
準シソーラス用語： 細胞溶解 ,  *DNA抽出 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (6件)： 底生シアノバクテリア ,  DNA抽出 ,  岩石付着性生物膜 ,  MO BIO ,  クロロホルム ,  Qiagen

分類 (1件)： 微生物検査法  (EG02020G)

タイトルに関連する用語 (4件)： シアノバクテリア ,  DNA抽出 ,  比較評価 ,  最適化