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J-GLOBAL ID：201702256608503818   整理番号：17A0450888

ナンキンマメ(Arachis hypogaeaL.)におけるマイクロRNAと標的遺伝子のマイニング,同定と機能解析【Powered by NICT】

Mining, identification and function analysis of microRNAs and target genes in peanut (Arachis hypogaea L.)

著者 (8件)： Zhang Tingting (Shandong Peanut Research Institute, Qingdao, 266100, China) ,  Hu Shuhao (Shandong Peanut Research Institute, Qingdao, 266100, China) ,  Hu Shuhao (Shandong University, Weihai, 264200, China) ,  Yan Caixia (Shandong Peanut Research Institute, Qingdao, 266100, China) ,  Li Chunjuan (Shandong Peanut Research Institute, Qingdao, 266100, China) ,  Zhao Xiaobo (Shandong Peanut Research Institute, Qingdao, 266100, China) ,  Wan Shubo (Shandong Academy of Agricultural Sciences, Jinan, 250100, China) ,  Shan Shihua (Shandong Peanut Research Institute, Qingdao, 266100, China)
資料名： Plant Physiology and Biochemistry  (Plant Physiology and Biochemistry)
巻： 111  ページ： 85-96  発行年： 2017年 
JST資料番号： W1643A  ISSN： 0981-9428  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： フランス (FRA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 本研究では,16ファミリーに属する,60個の保存されたナンキンマメ(Arachis hypogaeaL.)マイクロRNA(miRNA)配列はバイオインフォマティクス法を用いて同定した。392標的遺伝子配列,ターゲット整列ソフトウェアとBLASTx分析で58のmiRNAから同定した。遺伝子オントロジー(GO)機能解析は,これらの標的遺伝子は,ナンキンマメの成長と発育,シグナル伝達とストレス耐性に関与することを示唆した。は,ポリ(A)テーリング試験を用いて検証し,55のmiRNA配列91.67%までの成功率であった。ラッカセイ二十標的遺伝子配列を無作為に選択し,cDNA末端(5′ RACE)法の5′迅速増幅は,これらの標的遺伝子の切断部位を検証した。これらのうち,14(70%)ピーナッツmiRNA標的をゲル電気泳動,クローニングと配列決定法によって確認した。さらに,機能解析と相同配列検索は標的遺伝子配列で行った,26標的遺伝子はストレス耐性実験的研究の対象として選択した。リアルタイム蛍光定量的PCR(qRT PCR)技術は,Aspergillus flavus(黄色麹菌)感染と乾燥ストレスに曝露されたナンキンマメの耐性関連miRNAとその標的遺伝子の発現レベルを測定するために適用した。その結果,miRNAとターゲットの5群は,標的遺伝子の発現を制御する負のmiRNAのモードと一致したことが分かった。を予備的にいくつかの耐性関連miRNAの生物学的機能およびナンキンマメにおけるそれらの標的遺伝子を決定した。Copyright 2017 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【Powered by NICT】

シソーラス用語： cDNA ,  Aspergillus ,  ゲル電気泳動 ,  蛍光 ,  *機能分析 ,  *ナンキンマメ ,  定量的PCR法 ,  Aspergillus flavus
準シソーラス用語： 黄色麹菌 ,  乾燥ストレス ,  ストレス耐性 ,  遺伝子オントロジー ,  遺伝子配列 ,  バイオインフォマティクス ,  *標的遺伝子 ,  *マイクロRNA , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： バイオインフォマティクス ,  発現 ,  マイクロRNA ,  qRT-PCR ,  Resistance

分類 (2件)： 植物生理学一般  (EH02010Y) ,  遺伝子発現  (EC02040Q)

タイトルに関連する用語 (6件)： ナンキンマメ ,  Arachis ,  マイクロRNA ,  標的遺伝子 ,  同定 ,  機能解析