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J-GLOBAL ID：201702259903945226   整理番号：17A0165527

イネ科8種の牧草のDNAバーコード汎用配列のスクリーニング【JST・京大機械翻訳】

Screening of universal DNA barcodes for grass forages’eight species

著者 (9件)： Li Yongqing (Faculty of Animal Science and Technology,Gansu Agriculture University) ,  Jiao Ting (College of Pratacultural Science,Gansu Agricultural University,Key Laboratory of Grassland Ecosystem, Ministry of Education,Sino-U.S.Centers for Grazingland Ecosystem Sustaniability) ,  Wu Jianping (Faculty of Animal Science and Technology,Gansu Agriculture University) ,  Quan Jinqiang (Faculty of Animal Science and Technology,Gansu Agriculture University) ,  Wang Wenqiang (Faculty of Animal Science and Technology,Gansu Agriculture University) ,  Zheng Wangshan (Faculty of Animal Science and Technology,Gansu Agriculture University) ,  Guo Yongbo (Faculty of Animal Science and Technology,Gansu Agriculture University) ,  Yao Xixi (Faculty of Animal Science and Technology,Gansu Agriculture University) ,  Zhao Shengguo (Faculty of Animal Science and Technology,Gansu Agriculture University)
資料名： Caoye Kexue  (Caoye Kexue)
巻： 33  号： 9  ページ： 1702-1710  発行年： 2016年 
JST資料番号： C2659A  ISSN： 1001-0629  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： 中国 (CHN)  言語： 中国語 (ZH)

抄録/ポイント： DNAバーコード技術はDNA保存断片を利用して種を迅速かつ正確に同定する新興技術である。本研究では、GENBANKにおけるイネ科牧草牧草とRBCL遺伝子のヌクレオチド配列に基づき、4対の汎用プライマーを設計した。イネ科の7つの主要な牧草に属する8つの牧草の11のサンプル(高丹草 SORGHUM),トウモロコシ(ZEA MAYS), (STIPA CAPILLATA),「(多年 `),「(紫 PRATENSIS),甘粛(草原 PRATENSIS),と(草原 PRATENSIS), (草原 SPLENDENS), (ACHNATHERUM SPLENDENS), (草原 SPLENDENS),目的(SPLENDENS SPLENDENS),目的(草原 SPLENDENS),および (確立 SPLENDENS)について研究した。増幅産物の配列決定と分析を行い、8つの牧草の4つのマーカーの5’末端と3’末端保存配列をスクリーニングした。各標識部位の保存領域内のヌクレオチドに対して一塩基多型(SNPS)のハプロタイプ分析を行った。結果は以下を示す。MATK1、MATK2、MATK3はそれぞれ6つのハプロタイプ(H1~A、H1~B、H1~C、H1~D、H1~EとH1~F)、7つのハプロタイプ(H2~A、H2~B、H2~C、H2~D、H2~EとH3~C)、3つのハプロタイプ(H3~A、H3~BとH3~C)がある。RBCL遺伝子には5つのハプロタイプ(H4~A,H4~B,H4~C,H4~D,H4~E)がある。MATK(MATK1,MATK2,MATK3)とRBCL遺伝子によりスクリーニングされた4つの標識サイトは8種類の牧草に対応する特異的DNA識別子を確立した。本研究は,イネ科牧草飼料における属,,属,アクナテラム属,スティパ属,ライムギ属,トールフェスク属および 属の8種の牧草の正確な識別のための分子レベルの科学的基礎を提供することができた。Data from the ScienceChina, LCAS. Translated by JST【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 草原 ,  *牧草 ,  一塩基多型 ,  イネ科牧草 ,  ライムギ属 ,  ウシノケグサ属 ,  *スクリーニング ,  ハプロタイプ ,  ヌクレオチド配列 ,  *イネ科 ,  *DNA【核酸】
準シソーラス用語： ハプロタイプ分析 ,  保存配列 ,  アンプリコン ,  *DNAバーコード , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： haplotype combination ,  matK gene ,  rbcLgene ,  DNA barcoding ,  universal sequences

分類 (2件)： トウモロコシ  (FC03034D) ,  植物生理学一般  (EH02010Y)

タイトルに関連する用語 (5件)： イネ科 ,  牧草 ,  DNAバーコード ,  汎用 ,  スクリーニング