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J-GLOBAL ID：201702260341728924   整理番号：17A0343234

センリョウ葉の完全長CDNAライブラリー構築とEST配列解析を行った。【JST・京大機械翻訳】

Construction of full-length cDNA library of Sarcandra glabra and sequences analysis on EST

著者 (7件)： Xie Dejin (College of Forestry, Fujian Agriculture and Forestry University) ,  Shen Shaoyan (College of Landscape, Fujian Agriculture and Forestry University) ,  Yao Wang (College of Forestry, Fujian Agriculture and Forestry University) ,  Rong Jundong (College of Forestry, Fujian Agriculture and Forestry University) ,  He Tianyou (College of Landscape, Fujian Agriculture and Forestry University) ,  Chen Liguang (College of Forestry, Fujian Agriculture and Forestry University) ,  Zheng Yushan (College of Forestry, Fujian Agriculture and Forestry University)
資料名： Zhongcaoyao  (Zhongcaoyao)
巻： 47  号： 23  ページ： 4235-4241  発行年： 2016年 
JST資料番号： C2294A  ISSN： 0253-2670  CODEN： CTYAD8  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： 中国 (CHN)  言語： 中国語 (ZH)

抄録/ポイント： 【目的】センリョウ GLABRAの葉の完全長CDNAライブラリーを構築し,センリョウの代謝とストレス耐性に関連する遺伝子を発見し,センリョウ遺伝子の発見のための実験的基礎を提供する。方法:センリョウの若葉を実験材料とし、SMART法(即ちCLONTECH社のSMARTER試験キット)を利用して、センリョウの全長CDNAライブラリーを構築した。ABI3730 DNA配列解析配列を用いて、大量のEST配列を獲得し、生物情報分析方法を利用してEST配列に対して機能アノテーションを行った。【結果】センリョウ葉の完全長CDNAライブラリーを構築し,センリョウのCDNAライブラリーのライブラリーの力価は1.14×107CFU/MLであり,平均挿入フラグメントは1000BPであった。このライブラリーを用いて、221個の単クローンを配列し、合計EST配列177個を獲得し、151個の単一配列を連結した。NCBIデータベースを用いてホモロジー解析を行い,119本(79%)が既知遺伝子と顕著な相同性を有し,GO機能アノテーションを行い,その発現タームが細胞成長,シグナル伝達,蛋白質合成,転写,抗逆反応およびエネルギー代謝などに関与していることを示した。【結論】要求 葉の完全長CDNAライブラリーを構築し,関連するEST配列の生物情報学的解析を行い,センリョウの研究のためのいくつかの参照を提供した。Data from the ScienceChina, LCAS. Translated by JST【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 遺伝子 ,  タンパク質合成 ,  アノテーション ,  ホモロジー ,  *DNA【核酸】 ,  クローン ,  相同性 ,  データベース ,  細胞増殖
準シソーラス用語： バイオインフォマティクス ,  NCBI ,  生物情報 ,  *配列解析 ,  ストレス耐性 ,  *EST配列 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： Sarcandra glabra (Thunb.) Nakai ,  full-length cDNA library ,  expressed sequence tag ,  gene annotation ,  GO annotation

分類 (2件)： 遺伝子の構造と化学  (EC02020U) ,  遺伝子発現  (EC02040Q)

タイトルに関連する用語 (7件)： リョウ ,  葉 ,  完全長cDNA ,  ライブラリー ,  構築 ,  EST配列 ,  解析