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J-GLOBAL ID：201702264117974589   整理番号：17A0303571

CGE技術に基づくサトウキビSSR-PCR反応系の最適化【JST・京大機械翻訳】

Optimization and application of sugarcane SSR-PCR system based on CGE technology

著者 (7件)： Gui Yiyun (Sugarcane Research Institute, Guangxi Academy of Agricultural Sciences/...) ,  Chen Zhongliang (Sugarcane Research Institute, Guangxi Academy of Agricultural Sciences/...) ,  Qin Cuixian (Sugarcane Research Institute, Guangxi Academy of Agricultural Sciences/...) ,  Wang Miao (Sugarcane Research Institute, Guangxi Academy of Agricultural Sciences/...) ,  Liu Limin (Sugarcane Research Institute, Guangxi Academy of Agricultural Sciences/...) ,  Li Yangrui (Sugarcane Research Institute, Guangxi Academy of Agricultural Sciences/...) ,  Huang Dongliang (Sugarcane Research Institute, Guangxi Academy of Agricultural Sciences/...)
資料名： Nanfang Nongye Xuebao  (Nanfang Nongye Xuebao)
巻： 47  号： 9  ページ： 1463-1469  発行年： 2016年 
JST資料番号： C2960A  ISSN： 2095-1191  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： 中国 (CHN)  言語： 中国語 (ZH)

抄録/ポイント： [目的]キャピラリー電気泳動(CGE)技術に基づくサトウキビのSSR-PCR反応システムを最適化し、サトウキビの遺伝的多様性と近縁関係の研究、分子補助育種及び遺伝図鑑の構築に技術的サポートを提供する。[方法]CGE技術に基づき、直交試験設計を採用し、DNTP濃度、DNAポリメラーゼ量、プライマー濃度とDNA鋳型を考察因子として最適化し、最適なSSR-PCR反応体系を確定し、8つのサトウキビ遺伝資源材料の遺伝的多様性の分析に用いた。[結果]最適SSR-PCR反応系(20ΜL);DNTPSの濃度は0.15 MMOL/L、DNAポリメラーゼは1.5 U、プライマーの濃度は0.50 ΜMOL/L、DNAの濃度は25 NGであった。このシステムを用いて、8つの異なる国地域由来のサトウキビ遺伝資源に対して遺伝的多様性分析を行い、8対のSSRプライマーが合計101個の断片を増幅し、そのうち、多型断片は93個、多型率は92.1%であることが分かった。クラスター分析の結果,試験材料間の遺伝的類似性係数は0.521~0.871であり,類似性係数は0.614であり,すべての試験材料は2つのタイプに分けることができた。3つの国外生殖質材料PINDAR,CP72-1210,CP84-1198とROC20,GT69-156は1種類に分類された。一方,ROC26,GT02-237およびGT97-69はもう一つであった。[結論]CGE技術に基づくSSR-PCR反応システムの検出結果は安定で、再現性が良く、サトウキビの遺伝分析及び遺伝マッピングに適している。Data from the ScienceChina, LCAS. Translated by JST【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： DNA【核酸】 ,  類似性 ,  *反応系 ,  遺伝資源 ,  育種 ,  実験計画法 ,  *最適化 ,  クラスタ分析 ,  遺伝 ,  DNAポリメラーゼ ,  キャピラリー電気泳動 ,  *サトウキビ
準シソーラス用語： 遺伝子解析 ,  生殖質 ,  遺伝多様性 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： sugarcane ,  SSR molecular marker ,  capillary gel electrophoresis (CGE) ,  reaction system ,  genetic analysis

分類 (2件)： 微生物検査法  (EG02020G) ,  遺伝子の複製  (EC02030F)

タイトルに関連する用語 (3件)： CGE ,  サトウキビ ,  最適化