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J-GLOBAL ID：201702264230941426   整理番号：17A0258819

中華チョウザメの蚊全遺伝子のマイクロサテライトの同定、特徴及び分布規則を分析した。【JST・京大機械翻訳】

Identification, characteristics and distribution of microsatellites in the whole genome of Anopheles sinensis (Diptera: Culicidae)

著者 (5件)： Wang Xiaoting (Institute of Entomology and Molecular Biology, College of Life Sciences, Chongqing Normal University) ,  Zhang Yujuan (Institute of Entomology and Molecular Biology, College of Life Sciences, Chongqing Normal University) ,  He Xiu (Institute of Entomology and Molecular Biology, College of Life Sciences, Chongqing Normal University) ,  Mei Ting (Institute of Entomology and Molecular Biology, College of Life Sciences, Chongqing Normal University) ,  Chen Bin (Institute of Entomology and Molecular Biology, College of Life Sciences, Chongqing Normal University)
資料名： Kunchong Xuebao  (Kunchong Xuebao)
巻： 59  号： 10  ページ： 1058-1068  発行年： 2016年 
JST資料番号： W1455A  ISSN： 0454-6296  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： 中国 (CHN)  言語： 中国語 (ZH)

抄録/ポイント： 【目的】中華 SINENSISは中国および東南アジアにおける重要な輸送媒介者である。本研究では、全ゲノムの同定と分析により、中華チョウザメのマイクロサテライト遺伝子を同定し、マイクロサテライト関連遺伝子の機能を解釈し、遺伝的分子マーカーの選別に根拠を提供し、昆虫のマイクロサテライトの比較ゲノミクスの更なる研究に基礎を提供する。【方法】MISAプログラムを用いて,中華 遺伝子の遺伝子を同定した。EXCEL 2010統計微衛星の長さを用いて、マイクロの情報を結合してPERLスクリプトを作成し、微衛星Jian基の含有量を計算した。マイクロサテライトの位置情報を用いて,PERLの位置決めのための遺伝子座を作成し,そして,遺伝子機能領域におけるマイクロサテライトの機能的アノテーションを行った。WEGO 比較を用いて,中華 ととガンビエ 蚊を比較した。GAMBIAEはマイクロサテライト関連遺伝子機能アノテーションを含む。【結果】105個のマイクロサテライトを同定し,その密度は3365.5個/MBであった。その中で100個(94.7%)のマイクロサテライトは完全なマイクロ衛星であり、残りの5個(5.3%)は複合型の小型衛星である。単Jian基微の衛星は最も豊富で,共の衛星の数%を占めた。それらは,塩基(30%),,(15%),三(15%),番(1%),番(121%),番(121%),塩基(44%)および塩基(44%)であった。(A)Nは最も主要なマイクロサテライトであり,次は(AC)N,(AG)N,(C),N,(AGC)N,(ATC)N,(ACG)Nと(ACC)Nであり,数は2000以上である.中華の長さは10~20BP(87.1%)であった。これらのマイクロサテライトのAT含有量(63%)はGC含有量(37%)より明らかに高く、三塩基マイクロ衛星のGC含有量(53%)はAT含有量(47%)よりわずかに高かった。90個のマイクロサテライト(85%)は遺伝子間に分布し,15個のマイクロサテライト(15%)はマイクロサテライトに分布していた。基因区,,の(3%)マイクロサテライトはエキソン領域に分布し,12(12%)はイントロン領域に分布していた。GOの比較により、中華の蚊とガンビエの蚊の衛星の遺伝子を比較すると、この2つの種の各分類遺伝子の総遺伝子数のパーセンテージはほぼ一致していることが分かった。しかし、電子伝達系(ELECTRON CARRIER)遺伝子は中華のにに占める割合(0.9%)は、ガンビエ(蚊%)より明らかに高かった。【結論】これらの結果は,蚊の遺伝的変異,遺伝的変異,機能的遺伝子の遺伝的位置,および調節機構の研究のための基礎を提供するために,全ゲノムにおける蚊のマイクロサテライトの研究における最初の研究である。昆虫のマイクロサテライトの多様性と進化研究に科学的素材を蓄積した。Data from the ScienceChina, LCAS. Translated by JST【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： ゲノム ,  イントロン ,  *遺伝子 ,  アノテーション ,  *遺伝 ,  電子伝達系 ,  位置情報 ,  東南アジア ,  昆虫類
準シソーラス用語： 遺伝的変異 ,  小型衛星 ,  遺伝子機能 ,  スクリプト ,  比較ゲノミクス ,  分子マーカー , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (7件)： Anopheles sinensis ,  genome ,  microsatellites ,  characteristics ,  distribution ,  base content ,  GO annotation

分類 (2件)： 遺伝子の構造と化学  (EC02020U) ,  集団遺伝学  (EC01040J)

タイトルに関連する用語 (7件)： 蚊 ,  遺伝子 ,  マイクロサテライト ,  同定 ,  分布 ,  規則 ,  分析