文献

J-GLOBAL ID：201702266457649938   整理番号：17A0537316

TOXOPLASMA GONDIIROP16遺伝子のクローニング及びバイオインフォマティクス解析【JST・京大機械翻訳】

Cloning and bioinformatic analysis of rhoptry protein 16 of Toxoplasma gondii

著者 (5件)： Liu Nan (Pathogen Biology and Immunology Research Institute, Hebei North University) ,  Guo Lingling (Pathogen Biology and Immunology Research Institute, Hebei North University) ,  Zhang Jinshun (Pathogen Biology and Immunology Research Institute, Hebei North University) ,  Zhang Xiaolei (Pathogen Biology and Immunology Research Institute, Hebei North University) ,  Liu Rongrong (Pathogen Biology and Immunology Research Institute, Hebei North University)
資料名： Zhongguo Bingyuan Shengwu Xue Zazhi  (Zhongguo Bingyuan Shengwu Xue Zazhi)
巻： 11  号： 12  ページ： 1108-1113  発行年： 2016年 
JST資料番号： C3057A  ISSN： 1673-5234  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： 中国 (CHN)  言語： 中国語 (ZH)

抄録/ポイント： 【目的】TOXOPLASMA GONDIIの棒状16蛋白質(1616)の真核生物発現ベクターを構築し,TGROP16遺伝子コード化蛋白質の生物学的情報を分析する。【方法】TOXOPLASMA GONDIIの全RNAを抽出し,TGROP16遺伝子のオープンリーディングフレームに従ってプライマーを設計し,逆転写ポリメラーゼ連鎖反応(RT-PCR)によりROP16遺伝子を増幅し,ECOR I,生成物は大腸菌(E.COLI)XL1-BLUEに変換した。陽性コロニープラスミドを抽出し,PCR,二重酵素消化及び遺伝子配列決定を行い,得られた配列についてバイオインフォマティクス解析を行った。結果:TGROP遺伝子のRT-PCR増幅産物は予想される一致し、大きさは約2 100 BPであった。組換えプラスミドをPCRと二重酵素消化によって同定した。配列解析により,TGROP16遺伝子フラグメントは2BPであり,GENBANKに登録されたトキソプラズマROP16遺伝子配列(登録番号GQGQ)と一致し,一致率は99.8%であることを示した。予測された蛋白質TGROP16は貫通アミノ酸を含み,分子量は単位KUであり,分子量は76.1352KUであり,理論的等電点は9.18であった。TGROP16蛋白質の二次構造において,Α-ヘリックス,拡張,Β-ターン,およびランダムコイルの比率は,それぞれ%%,14.29%,7.07%,および42.86%であった。それらの多くは,ランダムコイルの立体配座を形成する領域とリン酸化部位のアミノ酸残基になり,39個のB細胞エピトープ,24個のCTLエピトープ,および33個のTH細胞エピトープを含んでいる。結論:PVAX1-ROP16真核生物発現組換えプラスミドの構築に成功し、生物情報学分析により、そのコードタンパク質TGROP16は良好な抗原性及び免疫原性を有し、トキソプラズマワクチン候補分子としてData from the ScienceChina, LCAS. Translated by JST【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 真核生物 ,  立体配座 ,  *プラスミド ,  エピトープ ,  分子量 ,  酵素的分解 ,  RT-PCR法 ,  免疫原性 ,  アミノ酸残基 ,  アミノ酸
準シソーラス用語： 遺伝子配列 ,  オープンリーディングフレーム ,  発現ベクター ,  *バイオインフォマティクス ,  *クローニング , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (4件)： Toxoplasma gondii ,  ROP16 ,  eukaryotic expression ,  bioinformatics analysis

分類 (2件)： ウイルスによる植物病害  (FC04054G) ,  遺伝子の構造と化学  (EC02020U)

タイトルに関連する用語 (4件)： Toxoplasma ,  遺伝子 ,  クローニング ,  バイオインフォマティクス解析