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J-GLOBAL ID：201702267055750524   整理番号：17A0351756

ターボットの成長形質関連単一ヌクレオチド多型の多家系検証【JST・京大機械翻訳】

Validation of Single Nucleotide Polymorphism(SNP)Loci Related to Growth Traits in Turbot(Scophthalmus maximus L.)Families

著者 (7件)： Tian Tao (College of Fisheries and Life Science,Shanghai Ocean University, The Key ...) ,  Wang Weiji (The Key Laboratory of Sustainable Development of Marine Fisheries,Ministry of ...) ,  Chen Zaizhong (College of Fisheries and Life Science,Shanghai Ocean University) ,  Hu Yulong (The Key Laboratory of Sustainable Development of Marine Fisheries,Ministry of ...) ,  Wang Mosang (College of Fisheries and Life Science,Shanghai Ocean University, The Key ...) ,  Lv Ding (The Key Laboratory of Sustainable Development of Marine Fisheries,Ministry of ...) ,  Li Zhixiang (College of Fisheries and Life Science,Shanghai Ocean University, The Key ...)
資料名： Zhongguo Haiyang Daxue Xuebao. Zirankexueban  (Zhongguo Haiyang Daxue Xuebao. Zirankexueban)
巻： 46  号： 12  ページ： 32-40  発行年： 2016年 
JST資料番号： C2597A  ISSN： 1672-5174  CODEN： ZHDXB3  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： 中国 (CHN)  言語： 中国語 (ZH)

抄録/ポイント： これらの結果は,多形性個体群において,ターボットの成長形質と密接に関連するSNP部位をさらに検証するためであった。本研究では、QTLマッピングマッピングにより得られた100個のターボット(SCOPHTHALMUS MAXIMUS L.)の生長性状に関連する候選単多型(SNP)の点を基に、飛行質量分析法を利用した。4つの個体群における遺伝子型を分析し,体重と体長の2つの成長形質データとの相関分析を行った。関連遺伝子座の多型を分析し,連鎖不平衡分析とハプロタイプ解析を行った。有意にの遺伝子配列情報に基づき,NCBIデータベースにおける比較分析を行い,整合した遺伝子機能を予備的に検討した。相関分析は,9つのSNP部位が成長形質と有意に相関していることを示した(P<0.05)。9つの遺伝子座において,4つの遺伝子座は体重と有意に相関し(P<0.05),7つの遺伝子座は体長と有意に相関し(P<0.05),SNP51とSNP111は体重と体長の2つの形質と有意に相関した(P<0.05)。SNP部位の多型性分析により、観測ヘテロ接合性は0.126~0.719の間(平均に)であり、ヘテロ接合性は0.118~0.501の間(平均0.338)であることが分かった。9つの遺伝子座の平均多型情報含有量は0.267であり,中程度の多型遺伝子座に属した。・平衡試験の結果,9つの遺伝子座には5つの座位が平衡していることが示された。連鎖不平衡とハプロタイプ分析により、マーカー間に顕著な連鎖不平衡が存在することが分かった。単一ととは2つの主要なハプロタイプであり,ハプロタイプ頻度はそれぞれ26.8%と25.9%であった。関連したSNP部位の配列情報に基づき,NCBI11A1とNOTCH1遺伝子は,NCBIの成長形質に関連する重要な機能遺伝子である可能性がある。本研究の結果は、ターボットの生長関連分子マーカーの研究を推進し、次の遺伝子座位と分子マーカー補助育種により多くの標識基礎を提供する。Data from the ScienceChina, LCAS. Translated by JST【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 個体群 ,  データベース ,  遺伝子型 ,  *一塩基多型 ,  育種 ,  遺伝子 ,  体重 ,  ハプロタイプ ,  体長
準シソーラス用語： 分子マーカー ,  ヘテロ接合性 ,  NCBI ,  遺伝子配列 ,  連鎖不平衡 ,  *イシビラメ , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (4件)： Scophthalmus maximus L. ,  growth trait ,  single nucleotide polymorphism(SNP) ,  association analysis

分類 (1件)： 遺伝的変異  (EC01030Y)

タイトルに関連する用語 (5件)： ターボット ,  成長形質 ,  単一ヌクレオチド多型 ,  家系 ,  検証