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J-GLOBAL ID：201702271219239806   整理番号：17A0094997

脊における細胞のバイオインフォマティクスとマイクロサテライト配列の特徴解析【JST・京大機械翻訳】

Bioinformatics and Microsatellite Sequences Analysis of EST Sequence in Ridge Tail Shrimp Exopalaemon carinicauda

著者 (5件)： Duan Yafei (Key Laboratory of South China Sea Fishery Resources Exploitation & Utilization,...) ,  Zhang Zhe (Key Laboratory of South China Sea Fishery Resources Exploitation & Utilization,...) ,  Li Jitao (Key Laboratory of Sustainable Development of Marine Fisheries,Ministry of ...) ,  Li Jian (Key Laboratory of Sustainable Development of Marine Fisheries,Ministry of ...) ,  Liu Ping (Key Laboratory of Sustainable Development of Marine Fisheries,Ministry of ...)
資料名： Shuichan Kexue  (Shuichan Kexue)
巻： 35  号： 5  ページ： 562-567  発行年： 2016年 
JST資料番号： C2602A  ISSN： 1003-1111  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： 中国 (CHN)  言語： 中国語 (ZH)

抄録/ポイント： 以前の配列決定により得られた脊 細胞細胞の2853のEST配列について、生物情報学とマイクロサテライト配列の特徴分析を行った。EST配列は,329本のUNIGENESを含み,329のCONTIGSと724の項を含んでいた。BLAST分析により,593(56.3%)のUINGENESはデータベース中の既知遺伝子と類似していることが示された。KEGG代謝経路分析により、181本のUNIGENESが120本の代謝経路にマッピングされることが明らかになった。EST-SSR分析により,416条微のマイクロサテライト配列が得られ,検出率は14.58%であった。それらの間で,2つの塩基配列反復配列は374であり,%%を占め,AG反復型が最も多かった。35塩基対は三%を占め,AAT反復型は最も多かった。4は7本で,1.68%を占め,AAGTのタイプは最も多かった。本研究は,脊の機能的遺伝子資源のマイニングと分子マーカーのスクリーニングのための有効なデータを提供することができた。Data from the ScienceChina, LCAS. Translated by JST【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 塩基対 ,  データベース ,  遺伝資源 ,  遺伝子 ,  *代謝経路 ,  ヌクレオチド配列
準シソーラス用語： 分子マーカー ,  検出率 ,  EST-SSR ,  KEGG ,  BLAST ,  EST配列 ,  *バイオインフォマティクス , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： Exopalaemon carinicauda ,  hemocyte ,  EST ,  bioinformatics ,  microsatellite

分類 (1件)： 分子・遺伝情報処理  (JE15040B)

タイトルに関連する用語 (4件)： 細胞 ,  バイオインフォマティクス ,  マイクロサテライト ,  特徴解析