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J-GLOBAL ID：201702272425020356   整理番号：17A0168239

EUCALYPTUS個体群の遺伝的多様性と選択された遺伝子座を選択した。【JST・京大機械翻訳】

Genetic Diversity and Selective Loci in Eucalyptus tereticornis Populations

著者 (9件)： Song Zhijiao (State Key Laboratory of Tree Genetics and Breeding (Chinese Academy of Forestry), Key Laboratory of State Forestry Administration on Tropical Forestry Research) ,  Yang Heyu (Key Laboratory of State Forestry Administration on Tropical Forestry Research Research Institute of Tropical Forestry,Chinese Academy of Forestry) ,  Weng Qijie (Key Laboratory of State Forestry Administration on Tropical Forestry Research Research Institute of Tropical Forestry,Chinese Academy of Forestry) ,  Zhou Changpin (Key Laboratory of State Forestry Administration on Tropical Forestry Research Research Institute of Tropical Forestry,Chinese Academy of Forestry) ,  Li Fagen (Key Laboratory of State Forestry Administration on Tropical Forestry Research Research Institute of Tropical Forestry,Chinese Academy of Forestry) ,  Li Mei (State Key Laboratory of Tree Genetics and Breeding (Chinese Academy of Forestry)) ,  Lu Wanhong (China Eucalypt Research Centre) ,  Luo Jianzhong (China Eucalypt Research Centre) ,  Gan Siming (State Key Laboratory of Tree Genetics and Breeding (Chinese Academy of Forestry), Key Laboratory of State Forestry Administration on Tropical Forestry Research Research)
資料名： Linye Kexue  (Linye Kexue)
巻： 52  号： 9  ページ： 39-47  発行年： 2016年 
JST資料番号： C2424A  ISSN： 1001-7488  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： 中国 (CHN)  言語： 中国語 (ZH)

抄録/ポイント： [目的]本研究の目的は,EUCALYPTUSの天然個体群の多様性レベルと遺伝的構造を分析し,生殖質資源管理と育種利用のための有用な情報を提供することである。EUCALYPTUSと原産地の気候因子との有意な関連を検出する遺伝子位は,気候適応過程におけるQu異選択の分子証拠を探索する。【方法】EUCALYPTUSの9つの個体群の77のサンプルを用いて,108のSSR遺伝子座(44の遺伝子群を含む)と64の遺伝子座を含む108のSSR遺伝子座をカバーした。個体群の多様性レベルと遺伝的構造を分析し,F_(ST)異常値を検出し,F_(ST)異常値を検出し,空間的分析法を用いて,原産地の気候因子と関連した適応性遺伝子座を探索した。適応性遺伝子座の機能を解釈し,対立遺伝子の各集団の頻度と気候因子の一次元線形回帰によりさらに関連の有意性を検証した。【結果】25の中性遺伝子座のSSR遺伝子座は,EUCALYPTUSの9つの個体群を増幅し,合計556の対立遺伝子フラグメントを検出し,遺伝子座の多型性は高かった。個体群の多様性レベルは高く,期待ヘテロ接合性は0.711~0.847(平均0.800),遺伝子豊富度は3.054~3.386(平均3.246)であり,各個体群の固有対立遺伝子数は6~26(平均14.4)であった。個体群間の分化レベルは低く、25個の中性点の平均F_(ST)は0.012であり、分子分散分析において、個体群間の分散成分はわずか1.2%であり、EUCALYPTUSの遺伝変異は主に個体群内に存在していることが示された。クラスタ分析は,個体群の分化レベルが低いことを示した。全部で108のF_(ST)異常値が検出され,年平均気温,年平均降水量,最高気温と季節的降水変動係数に関連したF_(ST)異常値はそれぞれ27,10,51と42であった。そのうち、4つのF_(ST)値異常の遺伝子座には、1つの対立遺伝子が1つ或いは2つの気候因子と顕著な相関があり、EUCESSRは485の季節性降水変動係数と関連しており、為富含Qiangのプロリンのタンパク質ファミリー遺伝子である。EUCESSRの年平均気温は年平均気温と年平均降水量と関連し、膜貫通酵素1,4-Β-グルカナーゼ遺伝子と同源であり、また2つの明確な機能アノテーションはなかった。線形回帰分析により、1つの対立遺伝子(EUCESSR485-140BP)と季節性降水変動係数の回帰性が著しいことが検証された(P≦0.05)。[結論]EUCALYPTUS個体群の遺伝的多様性は高く、育種利用の潜在力は大きく、遺伝資源管理は多様性が高く、特有の対立遺伝子が多い個体群を重視すべきである。EUCALYPTUS個体群の遺伝的分化は低く,関連遺伝分析に適していた。選択サイトの同定は,森林環境適応の分子機構を理解し,森林環境の適応性を探索するのに役立つ。Data from the ScienceChina, LCAS. Translated by JST【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 資源管理 ,  遺伝資源 ,  *個体群 ,  クラスタ分析 ,  異常値 ,  *遺伝子 ,  適応性 ,  育種 ,  変動係数 ,  *遺伝 ,  環境順応 ,  対立遺伝子
準シソーラス用語： 遺伝子解析 ,  ヘテロ接合性 ,  遺伝的構造 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： Eucalyptus tereticornis ,  SSR marker ,  genetic diversity ,  population structure ,  adaptation

分類 (2件)： 集団遺伝学  (EC01040J) ,  個体群生態学  (EE03030S)

タイトルに関連する用語 (4件)： Eucalyptus ,  個体群 ,  遺伝的多様性 ,  遺伝子座