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J-GLOBAL ID：201702274275775431   整理番号：17A0351633

トランスクリプトーム配列に基づくナスSSRマーカーの開発【JST・京大機械翻訳】

Development of SSR Markers for Eggplant with Transcriptome Sequencing Data

著者 (5件)： Wei Mingming (The Institute of Vegetables and Flowers,Chinese Academy of Agricultural Sciences) ,  Chen Yuhui (The Institute of Vegetables and Flowers,Chinese Academy of Agricultural Sciences) ,  Liu Fuzhong (The Institute of Vegetables and Flowers,Chinese Academy of Agricultural Sciences) ,  Zhang Ying (The Institute of Vegetables and Flowers,Chinese Academy of Agricultural Sciences) ,  Lian Yong (The Institute of Vegetables and Flowers,Chinese Academy of Agricultural Sciences)
資料名： Zhiwu Yichuan Ziyuan Xuebao  (Zhiwu Yichuan Ziyuan Xuebao)
巻： 17  号： 6  ページ： 1082-1091  発行年： 2016年 
JST資料番号： C2753A  ISSN： 1672-1810  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： 中国 (CHN)  言語： 中国語 (ZH)

抄録/ポイント： ナスソフトウェアを用いて,ナスBPののBPの長さをもつ45404のUNIGENES遺伝子を得て,その中で8316のSSR遺伝子座を検出し,その頻度は%%であった。平均は5.63 KBであった。SSR遺伝子座における一塩基重複のタイプは最も多く、5372個で、64.60%を占める。次に三は1628個を繰り返し,19.58%を占めている。三塩基反復の中で、AAGは優性反復ユニットであり、三塩基セチルトリメチルアンモニウムジクロメートの複数の31.6%を占める。塩基反復では/が優性重複ユニットであり,二の複数の42.3%を占める。プライマー 3により設計したプライマーを用いて,858対のSSRプライマーをランダムに選択し,ランダムに100対のプライマーを選択し,17のナス材料を増幅した。84対のバンドは明確なバンドを持ち,47対のプライマー対は多型フラグメントであった。47対の多型プライマーを分析し、多型情報含有量範囲は0.10~0.64、平均多型情報含有量は0.32、UPGMAクラスター分析は17種類の材料を3種類に分けることができる。以上の結果は,ナスのトランスクリプトーム配列決定に基づくSSRマーカーが,ナスの遺伝的多様性解析と遺伝的地図作成のためのより豊富なマーカーを提供することを示した。Data from the ScienceChina, LCAS. Translated by JST【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 優性 ,  遺伝 ,  クラスタ分析 ,  遺伝子 ,  地図作成 ,  *トランスクリプトーム
準シソーラス用語： 遺伝多様性 ,  トリヌクレオチド反復 ,  *マイクロサテライトマーカー , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： eggplant ,  transcriptome ,  SSR ,  primer ,  polymorphism

分類 (4件)： 分子遺伝学一般  (EC02010J) ,  遺伝子の構造と化学  (EC02020U) ,  遺伝子発現  (EC02040Q) ,  泌尿生殖器の腫よう  (GM04000S)

タイトルに関連する用語 (4件)： トランスクリプトーム ,  ナス ,  SSRマーカー ,  開発