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J-GLOBAL ID：201702277669037098   整理番号：17A0210028

DEsubs:RNA-seq実験結果を利用して差次的に発現された下位経路の柔軟な同定を行なうためのRパッケージ

DEsubs: an R package for flexible identification of differentially expressed subpathways using RNA-seq experiments

著者 (5件)： VRAHATIS Aristidis G. (Univ. Patras, Patras) ,  BALOMENOS Panos (Univ. Patras, Patras) ,  TSAKALIDIS Athanasios K. (Univ. Patras, Patras) ,  BEZERIANOS Anastasios (Univ. Patras, Patras) ,  BEZERIANOS Anastasios (National Univ. Singapore, Singapore)
資料名： Bioinformatics  (Bioinformatics)
巻： 32  号： 24  ページ： 3844-3846  発行年： 2016年12月15日 
JST資料番号： T0478A  ISSN： 1367-4803  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 短報  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： DEsubsは,RNA-seq実験によって記録された,経路ネットワーク中の疾病で撹乱される下位経路を抽出するネットワークベースのシステム生物学Rパッケージである。これを用いて事例特有のアプローチを実行することができる。DEsubsは,http://bioconductor.org/packages/DEsubs/で利用できる。

シソーラス用語： 遺伝学実験技術 ,  遺伝子発現 ,  経路 ,  同定 ,  プログラムパッケージ ,  ネットワーク ,  *病気 ,  擾乱 ,  生物学
準シソーラス用語： DEsubs ,  *RNA-seq ,  Rパッケージ ,  システム生物学 ,  撹乱 ,  *差次的発現 ,  疾病

分類 (2件)： その他の情報処理  (JE15050M) ,  遺伝子発現  (EC02040Q)

タイトルに関連する用語 (6件)： RNA-seq ,  実験結果 ,  発現 ,  経路 ,  同定 ,  Rパッケージ