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J-GLOBAL ID：201702279524363355   整理番号：17A0161961

ダイズPM34遺伝子のバイオインフォマティクス予測と発現解析【JST・京大機械翻訳】

Bioinformatics and the expression pattern analysis of soybean PM34 gene

著者 (5件)： Zhao Yan (College of Life Sciences and Agroforestry, Qiqihaer University) ,  Zhai Ying (College of Life Sciences and Agroforestry, Qiqihaer University) ,  Gong Guoqiang (Jilin Provincial Institute of Food Inspection) ,  Wang Man (College of Life Sciences and Agroforestry, Qiqihaer University) ,  Zhao Yang (College of Life Sciences and Agroforestry, Qiqihaer University)
資料名： Guangxi Zhiwu  (Guangxi Zhiwu)
巻： 36  号： 10  ページ： 1220-1224  発行年： 2016年 
JST資料番号： C2429A  ISSN： 1000-3142  CODEN： GUZHEI  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： 中国 (CHN)  言語： 中国語 (ZH)

抄録/ポイント： ダイズ葉の全RNAを鋳型とし、RT-PCR法を用いて、 2号品種から大豆種子成熟タンパク質(PM34)遺伝子配列をクローニングし、バイオインフォマティクス法を用いて、PM34遺伝子コードのタンパク質を予測した。結果は以下を示す。蛋白質の理論的分子量は31.7KDAであり,等電点は6.60であり,親水性蛋白質であった。この蛋白質は膜貫通構造を持たなかった。この蛋白質にはシグナルペプチドが存在しない。PM34遺伝子コード化蛋白質の二次構造において,Αヘリックスは12.97%,ランダムコイルは%%,Βシートは%%であった。PM34遺伝子のコード化タンパク質の三次構造予測により、相同性のモデリングのテンプレートは331.Aであり、一種の短鎖デヒドロゲナーゼ/還元酵素であり、このタンパクとの相同性は54.65%であることが明らかになった。進化関係では,リョクトウ,アルファルファとの近縁関係が比較的近い。リアルタイム定量的PCR(QRT-PCR)を用いて,ダイズの各器官におけるPM34遺伝子の発現パターンを検出し,その結果,根,茎,葉および花における遺伝子発現は低かったが,種子においては,特に成熟種子において相対的に高い活性を示した。本研究の結果は,ダイズのPM34遺伝子の構造と機能の更なる研究のための基礎を提供した。Data from the ScienceChina, LCAS. Translated by JST【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： *遺伝子 ,  デヒドロゲナーゼ ,  RT-PCR法 ,  三次構造 ,  シグナルペプチド ,  相同性 ,  分子量 ,  リョクトウ ,  タンパク質 ,  *ダイズ ,  モデリング ,  等電点
準シソーラス用語： クローニング ,  遺伝子配列 ,  *バイオインフォマティクス , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： soybean ,  PM34 gene ,  cloning ,  bioinformaics ,  qRT-PCR

分類 (1件)： 分子構造  (EB03020Y)

タイトルに関連する用語 (5件)： ダイズ ,  遺伝子 ,  バイオインフォマティクス ,  予測 ,  発現解析