文献

J-GLOBAL ID：201702280287420865   整理番号：17A0109778

ダイズシストセンチュウ4号のトランスクリプトーム配列決定と分析【JST・京大機械翻訳】

Transcriptome Sequencing and Analysis of Soybean (Glycine max) Resistance to Race 4 of Soybean Cyst Nematode (Heterodera glycines)

著者 (5件)： Wu Shufeng (Institute of Biological Engineering, Shanxi University, Key Laboratory of Crop Gene Resources and Germplasm Enhancement on Loess Plateau, Ministry of Agriculture) ,  Wang Zhi (Institute of Crop Germplasm Resources, Shanxi Academy of Agricultural Sciences; Key Laboratory of Crop Gene Resources and Germplasm Enhancement on Loess Plateau, Ministry of Agriculture, P. R. China) ,  Qiao Zhijun (Institute of Crop Germplasm Resources, Shanxi Academy of Agricultural Sciences; Key Laboratory of Crop Gene Resources and Germplasm Enhancement on Loess Plateau, Ministry of Agriculture, P. R. China) ,  Zhang Ruijun (Institute of Crop Germplasm Resources, Shanxi Academy of Agricultural Sciences; Key Laboratory of Crop Gene Resources and Germplasm Enhancement on Loess Plateau, Ministry of Agriculture, P. R. China) ,  Zhang Haiping (Institute of Crop Germplasm Resources, Shanxi Academy of Agricultural Sciences; Key Laboratory of Crop Gene Resources and Germplasm Enhancement on Loess Plateau, Ministry of Agriculture, P. R. China)
資料名： Nongye Shengwu Jishu Xuebao  (Nongye Shengwu Jishu Xuebao)
巻： 24  号： 4  ページ： 519-529  発行年： 2016年 
JST資料番号： C2715A  ISSN： 1674-7968  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： 中国 (CHN)  言語： 中国語 (ZH)

抄録/ポイント： ダイズシストセンチュウ(SOYBEAN CYST NEMATODE,SCN)(HETERODERA GLYCINES)は世界的なダイズ(GLYCINE MAX)病害である。本研究では、SCN4号の生理的マウスの黒豆を研究対象とし、ダイズシストセンチュウの感染後の二つの発育時期に対して、トランスクリプトームシークエンシングと生物情報学分析を行い、ダイズの抗病性メカニズムをマクロ的に理解した。ILLUMINA HISEQ(TM)2500により,1.96×10(10)BPのデータを得た。分析の後、接種後9日目(第1期)と接種後17日目(第二期)にそれぞれ2個と差個の差異発現遺伝子が得られ、同時に、差異発現遺伝子に対して遺伝子オントロジー(GENE ONTOLOGY,GO)のアノテーションを行った。蛋白質オーソロ相同(CLUSTERS OF ORTHOLOGOUS GROUPS OF PROTEINS,COG)アノテーションは,GOアノテーションとCOGアノテーションがそれぞれ差次的に発現する遺伝子を58と25の機能クラスに分類することを示した。また、京都遺伝子とゲノムシソーラス(KYOTO ENCYCLOPEDIA OF GENES AND GENOMES, KEGG)の濃縮分析の結果は以下のことを表明した。2つの時期の差異発現遺伝子はそれぞれ83と105の具体的な代謝経路の分枝に位置することができる。その中に、ホルモンシグナル伝達経路、フェニルアラニン代謝、エネルギー代謝などの過程における差異遺伝子が最も多く、これらのデータは抗病性の重要な遺伝子及び機能検証のさらなる研究に根拠を提供した。Data from the ScienceChina, LCAS. Translated by JST【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 代謝経路 ,  代謝 ,  アノテーション ,  *ダイズ ,  エネルギー代謝 ,  遺伝子 ,  京都府 ,  感染 ,  *トランスクリプトーム ,  アミノ酸 ,  芳香族化合物 ,  第一アミン
準シソーラス用語： 伝達経路 ,  遺伝子オントロジー ,  バイオインフォマティクス ,  クロマメ ,  *Heterodera glycines , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (4件)： Soybean ,  Soybean cyst nematode(SCN) ,  Transcriptome sequencing ,  Functional annotation

分類 (2件)： 豆類  (FC03035U) ,  線虫による植物被害  (FC04073L)

物質索引 (1件)： フェニルアラニン

タイトルに関連する用語 (3件)： ダイズシストセンチュウ ,  トランスクリプトーム ,  分析