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J-GLOBAL ID：201702281178883044   整理番号：17A0072238

肺動脈高血圧症における肺血管内皮間質転換関連MIRNASネットワーク調節のバイオインフォマティクス解析【JST・京大機械翻訳】

MicroRNAs integrates pathogenic signaling to control endothelial-mesenchymal transition in pulmonary hypertension: results of a network bioinformatic approach

著者 (7件)： Zhang Weifang (Dept of Pharmacy,the Second Affiliated Hospital of Nanchang University) ,  Xiong Aizhen (Dept of Pharmacy,the Second Affiliated Hospital of Nanchang University) ,  Wu Weihua (Dept of Pharmacology,Hunan University of Medicine) ,  Zhu Tiantian (Dept of Pharmacology,School of Pharmaceutical Sciences,Central South University) ,  Zou Xiaozhou (Dept of Pharmacology,School of Pharmaceutical Sciences,Central South University) ,  Liu Ting (Dept of Pharmacology,School of Pharmaceutical Sciences,Central South University) ,  Hu Changping (Dept of Pharmacology,School of Pharmaceutical Sciences,Central South University)
資料名： Zhongguo Yaolixue Tongbao  (Zhongguo Yaolixue Tongbao)
巻： 32  号： 9  ページ： 1294-1300  発行年： 2016年 
JST資料番号： C2291A  ISSN： 1001-1978  CODEN： ZYTOE8  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： 中国 (CHN)  言語： 中国語 (ZH)

抄録/ポイント： 【目的】肺動脈高血圧症(PH)における肺血管内皮間質転換(ENDMT)関連MIRNASおよびその下流標的のネットワーク制御を調査する。方法:文献においてPH関連遺伝子及びEND-MT/EMT関連MIRNASをマイニングした。遺伝子相互作用関係をBIOLOGICAL GENERAL REPOSITORY FOR INTERACTION DATASETS(BIOGRID)データベースを用いて得た。バイオインフォマティクス((3,MIRANDA4,PICTAR5,TARGETSCAN6,,7およびMICROT-CDS8)を用いて,MIRNASの標的遺伝子を予測した。超幾何学的分析は肺高血圧症に関連するMIRNASを予測し、MIRNASが機能区域に参与する状況において、最も高いスコアのMIRNASを選別し、部分を選択し、実験検証を行った。MIRNAS 3ソフトウェアを用いてMIRNASとその下流標的の相互作用ネットワークを構築した。結果:文献によりPHに関連する遺伝子230個を発掘し、ENDMT/EMT関連MIRNASと189個、体322個に対応した。そのうち98個のMIRNASはPH時のENDMTと関係があるかもしれない。そのうち、22個のMIRNASは同時にTGF-Β/BMP、低酸素と炎症の3つの機能経路に参与し、採点は最も高かった。それらは,それぞれMIR-LET-7ファミリー,MIR-124,MIR-130ファミリー,MIR-135,MIR-144,MIR-149,MIR-155,MIR-16,MIR-200,MIR-27,MIR-29,MIR-301,MIR-31,MIR-361,MIR-27,MIR-27,MIR-27,MIR-361,MIR-27,MIR-361,MIR-361,MIR-31,MIR-361およびMIR-375であった。LET-7G、MIR-21、MIR-124及びMIR-130ファミリーに対してリアルタイム蛍光定量PCR検証を行い、低酸素誘導PHラット肺動脈における発現はいずれも明らかに変化することが分かった。結論:生物学的情報技術を用い、大量のMIRNASからスクリーニングした22個のMIRNASは同時にTGF-Β/BMP、低酸素と炎症シグナル経路に関与し、PH時のENDMTと関係があり、今後のPHの研究に重要な理論的根拠を提供した。Data from the ScienceChina, LCAS. Translated by JST【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 炎症 ,  *ネットワーク ,  *肺動脈 ,  遺伝子 ,  蛍光 ,  肺高血圧症 ,  情報技術 ,  定量的PCR法 ,  酸素欠乏 ,  データベース ,  *間質組織
準シソーラス用語： 標的遺伝子 ,  遺伝子相互作用 ,  *バイオインフォマティクス ,  *肺動脈高血圧症 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (7件)： pulmonary hypertension ,  miRNAs ,  End- MT ,  network regulation ,  bioinformatics ,  network pharmacology ,  interaction

分類 (2件)： 循環系の疾患  (GJ03000C) ,  循環系の基礎医学  (GJ01020K)

タイトルに関連する用語 (7件)： 肺動脈高血圧症 ,  肺 ,  血管内皮 ,  間質 ,  転換 ,  調節 ,  バイオインフォマティクス解析