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J-GLOBAL ID：201702283331476003   整理番号：17A0537276

ブタ繁殖と呼吸症候群ウイルス四川株の分離同定とNSP2バイオインフォマティクス解析【JST・京大機械翻訳】

Identification of porcine reproductive and respiratory syndrome virus strains from Sichuan and Nsp2 bioinformatics analysis

著者 (10件)： Mao Xiyu (Animal Biotechnology Center,Sichuan Agricultural University) ,  Zhou Yuancheng (Animal Biotechnology Center,Sichuan Agricultural University) ,  Zhao Jun (Animal Biotechnology Center,Sichuan Agricultural University) ,  Yin Yue (Animal Biotechnology Center,Sichuan Agricultural University) ,  Lu Wenting (Animal Biotechnology Center,Sichuan Agricultural University) ,  Deng Yichao (Animal Biotechnology Center,Sichuan Agricultural University) ,  Fan Yi (Animal Biotechnology Center,Sichuan Agricultural University) ,  Xu Siyao (Animal Biotechnology Center,Sichuan Agricultural University) ,  Zhu Ling (Animal Biotechnology Center,Sichuan Agricultural University, Key Laboratory of Animal Disease and Human Health of Sichuan Province) ,  Xu Zhiwen (Animal Biotechnology Center,Sichuan Agricultural University, Key Laboratory of Animal Disease and Human Health of Sichuan Province)
資料名： Zhongguo Shouyikexue  (Zhongguo Shouyikexue)
巻： 46  号： 12  ページ： 1497-1504  発行年： 2016年 
JST資料番号： C3087A  ISSN： 1673-4696  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： 中国 (CHN)  言語： 中国語 (ZH)

抄録/ポイント： 四川省のブタ繁殖と呼吸症候群ウイルス(PRRSV)の流行状況及び分子特徴を調べるため、本研究では、2012年から2014年にかけて異なる地域で採集し、PRRSV陽性サンプルとし、MARC3145細胞ウイルス遺伝子の増幅、配列決定後、NCBIの既存配列との比較分析を行い、系統樹を構築するなどの方法により、分離株の分子特徴を研究した。10株のPRRSVの分離に成功し,すべての分離株が高病原性ブタ繁殖と呼吸症候群ウイルス(HP-PRRSV)株であり,配列比較により,以下のことを示した。SC2012とSC2012-2株のNSP2遺伝子は,多くのHP-PRRSV株と91%-97%のヌクレオチド同一性を示し,古典的株のCH-1A株との相同性は72.9%でありCH-1A,BJ-4株と比較して,NSP2蛋白質の4853AA-4983AAには14の連続的アミノ酸欠失があり,他の8株には30の不連続アミノ酸欠失があった。アミノ酸相同性の比較により、SC2012、SC2012-2株の変異率は中国国内の分離株とは61.5%~97.2%の間であることが示された。SC2012,SCSN2012-1,SCSN2012-2,SCCD2012,SCLS2012,SCMY2012,SCBZ2012,,2012, 2012およびSC2012-2のウイルス量は,それぞれ10(-5.41)/ML,以上の結果により、本研究所が分離したSC2012、SC2012-2株は新しい変異株であり、四川省のPRRSV分子疫学と遺伝変異の研究に一定の基礎を築いた。Data from the ScienceChina, LCAS. Translated by JST【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 変異 ,  不連続性 ,  系統樹 ,  *ウイルス ,  ウイルス遺伝子 ,  アミノ酸 ,  相同性 ,  病原性 ,  *繁殖行動
準シソーラス用語： 分子疫学 ,  分離株 ,  NCBI ,  ブタ繁殖呼吸障害症候群ウイルス ,  四川省 ,  *バイオインフォマティクス , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (4件)： PRRSV ,  isolation and identification ,  Nsp2 gene ,  bioinformatics analysis

分類 (2件)： 遺伝子の構造と化学  (EC02020U) ,  ウイルス感染の生理と病原性  (EG04042Y)

タイトルに関連する用語 (8件)： ブタ ,  繁殖 ,  呼吸 ,  症候群 ,  ウイルス ,  株 ,  同定 ,  バイオインフォマティクス解析