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J-GLOBAL ID：201702283368779206   整理番号：17A0124123

情報ISSRマーカー支援歩留り改善におけるOryza rufipogonの遺伝的に異なる系統を同定する【Powered by NICT】

Informative ISSR Markers Help Identify Genetically Distinct Accessions of Oryza rufipogon in Yield Improvement

著者 (6件)： Haritha G (ICAR, Indian Institute of Rice Research) ,  Sudhakar T (ICAR, Indian Institute of Rice Research) ,  Chandra D (ICAR, Indian Institute of Rice Research) ,  Ram T (ICAR, Indian Institute of Rice Research) ,  Divya B (ICAR, Indian Institute of Rice Research) ,  Sarla N (ICAR, Indian Institute of Rice Research)
資料名： Shuidao Kexue  (Shuidao Kexue)
巻： 23  号： 5  ページ： 225-241  発行年： 2016年 
JST資料番号： C2861A  ISSN： 1672-6308  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： 中国 (CHN)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 単純反復配列間(ISSR)多型は,世界の異なる地理的地域からのOryzaの野生種および栽培種の90遺伝子型の遺伝的多様性と系統発生関係を決定するために用いた。ISSR-PCRで用いた17種すべてのプライマーでは,合計11464のバンドは253バンド位置/遺伝子座で増幅した。プライマーUBC809は21バンド位置で最大バンド(1059)を増幅した。UBC810,とUBC356,511,662,835は7および14バンド位置で各391バンドの最小を増幅した。平均多型情報含有量は0.44から0.84の範囲であり,分解能は8.69~23.53の範囲であった。17プライマーに基づく算術平均系統樹と個体群構造を伴う非重みづけ対群法は全ての遺伝子型を分離した53%~ 100%の遺伝的類似性を持つ4種の主要なクラスタに分けた。最初の二つのクラスタが各30O.rufipogon系統から成っていた。第三群では,O.nivara及びO.longistaminataは1つのサブクラスタと他の全てのO.nivaraアクセションと栽培品種別のサブクラスタに分類として分類した。第四群は新しい遺伝子の源となり得るのみ五O.rufipogon系統を持っていた。四亜集団がK=7でO.nivara内のO.rufipogonと二亜集団内で同定した。高分解能値を持つ六プライマーのサブセットは最も有益であり,17プライマーはとほぼ同様にすべての遺伝子型を分類した。ISSR-PCRにおけるこれら六つの非常に有益なプライマーの利用は,野生イネ種の大規模生殖質コレクションにおける遺伝的多様性を評価するためのコスト効果的でロバストな方法である。Data from the ScienceChina, LCAS. Translated by JST【Powered by NICT】

シソーラス用語： 遺伝子型 ,  分解能 ,  *イネ属 ,  系統樹 ,  クラスタ ,  系統発生 ,  *遺伝 ,  栽培品種 ,  遺伝子
準シソーラス用語： 生殖質 ,  個体群構造 ,  ISSR-PCR ,  遺伝多様性 ,  野生種 ,  *ISSR , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： Oryza ,  野生種 ,  遺伝的多様性 ,  個体群構造 ,  単純配列反復間

分類 (1件)： 稲作  (FC03020C)

タイトルに関連する用語 (6件)： ISSRマーカー ,  支援 ,  歩留り ,  Oryza ,  系統 ,  同定