文献

J-GLOBAL ID：201702283419328908   整理番号：17A0265940

ビンクリスチンは選好性分析を使用した。【JST・京大機械翻訳】

Codon usage bias of Catharanthus roseus

著者 (5件)： Li Ying (Institute of Medicinal Plant Development,China Academy of Medical Sciences and Peking Union Medical College) ,  Kuang Xuejun (Institute of Medicinal Plant Development,China Academy of Medical Sciences and Peking Union Medical College) ,  Zhu Xiaoxuan (Institute of Medicinal Plant Development,China Academy of Medical Sciences and Peking Union Medical College) ,  Zhu Yingjie (Institute of Chinese Materia Medica,China Academy of Chinese Medical Sciences) ,  Sun Chao (Institute of Medicinal Plant Development,China Academy of Medical Sciences and Peking Union Medical College)
資料名： Zhongguo Zhongyao Zazhi  (Zhongguo Zhongyao Zazhi)
巻： 41  号： 22  ページ： 4165-4168  発行年： 2016年 
JST資料番号： C2264A  ISSN： 1001-5302  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： 中国 (CHN)  言語： 中国語 (ZH)

抄録/ポイント： 長春花を研究対象とし、そのコドン使用選好性を分析し、関連遺伝子の異種発現、遺伝子の予測、種の進化研究に指導を提供する。本研究では、長春花の30のタンパク質コード配列をデータソースとし、ビンブラスチンの組成とコドンの偏向の各パラメータに対して計算と統計分析を行った。ビンクリスチン(アルカロイド インドール ALKALOIDS,TIAS)生合成経路において25個の鍵酵素遺伝子が大腸菌あるいはSACCHAROMYCES CEREVISIAEの希少コドンを含む割合を計算した。その結果,長遺伝子の平均GC量は42.47,コドン3番目の塩基の平均GC量は%であった。長春花には28個のコドンの同義コドン相対使用度(RELATIVE SYNONYMOUS コドン USAGE,RSCU)が1より大きく、そのうち26個はAまたはTで終わる。25個の鍵酵素遺伝子が大腸菌の希少コドンの割合は明らかにSACCHAROMYCES CEREVISIAEの希少コドンの割合より高かった。長春花は主にAとTで終わるコドンを使用する。SACCHAROMYCES CEREVISIAEと比較して,そののコドン利用特性は大腸菌との差異が大きく,SACCHAROMYCES CEREVISIAEが長期間のニチニチソウ遺伝子の異種発現宿主である可能性があると推測された。Data from the ScienceChina, LCAS. Translated by JST【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： *嗜好性 ,  ニチニチソウ ,  タンパク質 ,  コドン ,  大腸菌 ,  遺伝子 ,  統計解析 ,  脂肪酸 ,  窒素複素環化合物 ,  インドールアルカロイド ,  架橋化合物 ,  フェノールエーテル ,  芳香族縮合化合物 ,  カルボン酸エステル ,  ジオール ,  ヒドロキシ酸 ,  カルボアミド
準シソーラス用語： 使用頻度 ,  酵素遺伝子 ,  生合成経路 ,  異種発現 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： Catharanthus roseus ,  genome ,  codon bias ,  terpenoid indole alkaloids ,  biosynthetic pathways

分類 (1件)： 遺伝子発現  (EC02040Q)

物質索引 (2件)： ビンブラスチン ,  ビンクリスチン

タイトルに関連する用語 (3件)： ビンクリスチン ,  選好性 ,  分析