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J-GLOBAL ID：201702283535266952   整理番号：17A0280130

マイクロアレイにより明らかにされた腹部大動脈瘤の長鎖非コードRNA発現特性【Powered by NICT】

Long Noncoding RNA Expression Signatures of Abdominal Aortic Aneurysm Revealed by Microarray

著者 (7件)： Yang Yaoguo (The Department of Vascular Surgery, Beijing Anzhen Hospital, Capital Medical University) ,  Li Meixia (Institute of Biophysics, Chinese Academy of Sciences) ,  Kou Lei (The Department of Vascular Surgery, Beijing Anzhen Hospital, Capital Medical University) ,  Zhou You (The Department of Vascular Surgery, Beijing Anzhen Hospital, Capital Medical University) ,  Qin Yanwen (The Department of Vascular Surgery, Beijing Anzhen Hospital, Capital Medical University) ,  Liu Xiaojun (Institute of Basic Medical Sciences Chinese Academy of Medical Sciences & School of Basic Medicine Peking Union Medical College) ,  Chen Zhong (The Department of Vascular Surgery, Beijing Anzhen Hospital, Capital Medical University)
資料名： Biomedical and Environmental Sciences  (Biomedical and Environmental Sciences)
巻： 29  号： 10  ページ： 713-723  発行年： 2016年 
JST資料番号： C2560A  ISSN： 0895-3988  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： 中国 (CHN)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 目的本研究は,腹部大動脈瘤(AAA)の病因における長鎖非コードRNA(lncRNA)の役割を観察することを目的としている。方法LncRNAとm RNA発現サインAAA組織と正常腹部大動脈組織(NT)をマイクロアレイにより分析し,さらに実時間定量的逆転写PCR(qRT PCR)によって検証した。標的関係lncRNA mRNAは計算機解析を用いて同定した。5 リポオキシゲナーゼ(ALOX5)発現に及ぼすLnC ARGの影響はHeLa細胞で試験した。3,688lncRNA及び3,007mRNAの異なる発現はAAAとNT組織間で同定された。さらに,1,284は長い遺伝子間非コードRNAを特異的に発現し,蛋白質をコードする遺伝子に隣接する206の差次的発現エンハンサー様lncRNAは,バイオインフォマティクス分析によって識別された。AAAと正常組織試料の間のいくつかの差次的に発現したlncRNAとm RNAは,qRT-PCRを用いて検証した。符号化と非コード遺伝子の共発現ネットワークは差次的に発現したlncRNAとm RNAの間の相関分析に基づいて構築した。さらに,ALOX5の上流内に位置するLnC ARGは計算機解析を用いて蛋白質をコードする可能性を解析することにより非コード転写物として分類した。LnC ARGはHeLa細胞におけるALOX5と活性酸素種産生のmRNAレベルを減少させることができることを見出した。結論:本研究はAAAの病因に関連した新しいlncRNA候補を明らかにした。Data from the ScienceChina, LCAS. Translated by JST【Powered by NICT】

シソーラス用語： HeLa細胞 ,  逆転写 ,  遺伝子 ,  病因 ,  mRNA ,  *長鎖 ,  *腹大動脈
準シソーラス用語： 相関分析 ,  共発現 ,  バイオインフォマティクス ,  差次的遺伝子発現 ,  コンピュータ解析 ,  *非翻訳RNA ,  *腹部大動脈瘤 ,  *マイクロアレイ , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (4件)： lncRNA ,  腹部大動脈りゅう ,  LnC ARG ,  ALOX5

分類 (3件)： 循環系の疾患  (GJ03000C) ,  循環系の診断  (GJ02000V) ,  循環系モデル  (EL02020V)

タイトルに関連する用語 (4件)： マイクロアレイ ,  腹部大動脈瘤 ,  長鎖非コードRNA ,  発現