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J-GLOBAL ID：201702283723281758   整理番号：17A0412765

標的プロテオミクスにおける相対保持時間の利用を評価するための多施設研究【Powered by NICT】

A multicentric study to evaluate the use of relative retention times in targeted proteomics

著者 (58件)： Vialas Vital (ProteoRed-ISCIII, Universidad Complutense de Madrid, Madrid 28040, Spain) ,  Colome-Calls Nuria (ProteoRed-ISCIII, Vall d’Hebron Institute of Oncology (VHIO), Barcelona 08035, Spain) ,  Abian Joaquin (ProteoRed-ISCIII, Instituto de Investigaciones Biomedicas de Barcelona, IIBB-CSIC/IDIBAPS, Barcelona 08036, Spain) ,  Aloria Kerman (Department of Biochemistry and Molecular Biology, University of the Basque Country-UPV/EHU, Leioa 48940, Spain) ,  Alvarez-Llamas Gloria (ProteoRed-ISCIII, IIS Fundacion Jimenez Diaz, Madrid, Spain) ,  Antunez Oreto (ProteoRed-ISCIII, SCSIE Universitat de Valencia, Burjassot 46100, Spain) ,  Arizmendi Jesus M. (ProteoRed-ISCIII, University of the Basque Country-UPV/EHU, Leioa 48940, Spain) ,  Azkargorta Mikel (ProteoRed-ISCIII, CIC bioGUNE, Science and Technology Park of Bizkaia, Derio, Spain) ,  Barcelo-Batllori Silvia (ProteoRed-ISCIII, Bellvitge Biomedical Research Institute (IDIBELL), Barcelona, Spain) ,  Barderas Maria G. (ProteoRed-ISCIII, Hospital Nacional de Paraplejicos-SESCAM, Toledo, Spain) ,  Blanco Francisco (ProteoRed-ISCIII, INIBIC-CHUAC, A Coruna 15006, Spain) ,  Casal J. Ignacio (ProteoRed-ISCIII, Centro de Investigaciones Biologicas-CSIC, Madrid 28040, Spain) ,  Casas Vanessa (ProteoRed-ISCIII, Instituto de Investigaciones Biomedicas de Barcelona, IIBB-CSIC/IDIBAPS, Barcelona 08036, Spain) ,  de la Torre Carolina (ProteoRed-ISCIII, Bellvitge Biomedical Research Institute (IDIBELL), Barcelona, Spain) ,  Chicano-Galvez Eduardo (ProteoRed-ISCIII, Maimonides Institute for Biomedical Research and Universidad de Cordoba, Cordoba 14004, Spain) ,  Elortza Felix (ProteoRed-ISCIII, CIC bioGUNE, Science and Technology Park of Bizkaia, Derio, Spain) ,  Espadas Guadalupe (ProteoRed-ISCIII, Centre de Regulacio Genomica, Universitat Pompeu Fabra, Barcelona 08003, Spain) ,  Estanyol Josep M. (ProteoRed-ISCIII, Scientific and Technological Centers (CCiTUB), University of Barcelona, Barcelona 08036, Spain) ,  Fernandez-Irigoyen Joaquin (ProteoRed-ISCIII, Navarrabiomed Biomedical Research Center-IdiSNa, Pamplona, Spain) ,  Fernandez-Puente Patricia (ProteoRed-ISCIII, INIBIC-CHUAC, A Coruna 15006, Spain) ,  Fidalgo Maria Jose (ProteoRed-ISCIII, Scientific and Technological Centers (CCiTUB), University of Barcelona, Barcelona 08036, Spain) ,  Fuentes Manuel (ProteoRed-ISCIII, Cancer Research Center, University of Salamanca-CSIC, IBSAL, Salamanca 37007, Spain) ,  Gay Marina (ProteoRed-ISCIII, Institute for Research in Biomedicine (IRB Barcelona), Barcelona 08028, Spain) ,  Gil Concha (ProteoRed-ISCIII, Universidad Complutense de Madrid, Madrid 28040, Spain) ,  Hainard Alexandre (Proteomics Core Facility CMU, University of Geneva, Geneva, Switzerland) ,  Hernaez Maria Luisa (ProteoRed-ISCIII, Universidad Complutense de Madrid, Madrid 28040, Spain) ,  Ibarrola Nieves (ProteoRed-ISCIII, Cancer Research Center, University of Salamanca-CSIC, IBSAL, Salamanca 37007, Spain) ,  Kopylov Arthur T. (Orekhovich Institute of Biomedical Chemistry RAMS, Moscow 119121, Russian Federation) ,  Lario Antonio (ProteoRed-ISCIII, IPBLN (CSIC), Armilla, Granada, Spain) ,  Lopez Juan Antonio (ProteoRed-ISCIII, Centro Nacional de Investigaciones Cardiovasculares Carlos III (CNIC), Madrid 28029, Spain) ,  Lopez-Lucendo Maria (ProteoRed-ISCIII, Centro de Investigaciones Biologicas-CSIC, Madrid 28040, Spain) ,  Marcilla Miguel (ProteoRed-ISCIII, Centro Nacional de Biotecnologia (CSIC), Madrid 28049, Spain) ,  Marina-Ramirez Anabel (ProteoRed-ISCIII, CBM Severo Ochoa (CSIC-UAM), Madrid 28049, Spain) ,  Marko-Varga Gyorgy (Centre of Excellence in Biological and Medical Mass spectrometry, Lund University, Lund, Sweden) ,  Martin Luna (ProteoRed-ISCIII, Vall d’Hebron Institute of Oncology (VHIO), Barcelona 08035, Spain) ,  Mora Maria I. (ProteoRed-ISCIII, CIMA, University of Navarra, Pamplona 31008, Spain) ,  Morato-Lopez Esperanza (ProteoRed-ISCIII, CBM Severo Ochoa (CSIC-UAM), Madrid 28049, Spain) ,  Munoz Javier (ProteoRed-ISCIII, Spanish National Cancer Research Centre (CNIO), Madrid 28029, Spain) ,  Odena Maria Antonia (ProteoRed-ISCIII, Barcelona Science Park, Barcelona 08028, Spain) ,  de Oliveira Eliandre (ProteoRed-ISCIII, Barcelona Science Park, Barcelona 08028, Spain) ,  Orera Irene (ProteoRed-ISCIII, Instituto Aragones de Ciencias de la Salud, Zaragoza 50009, Spain) ,  Ortea Ignacio (ProteoRed-ISCIII, Maimonides Institute for Biomedical Research and Universidad de Cordoba, Cordoba 14004, Spain) ,  Pasquarello Carla (Proteomics Core Facility CMU, University of Geneva, Geneva, Switzerland) ,  Ray Kevin B. (MilliporeSigma, St. Louis, MO, USA) ,  Rezeli Melinda (Centre of Excellence in Biological and Medical Mass spectrometry, Lund University, Lund, Sweden) ,  Ruppen Isabel (ProteoRed-ISCIII, Spanish National Cancer Research Centre (CNIO), Madrid 28029, Spain) ,  Sabido Eduard (ProteoRed-ISCIII, Centre de Regulacio Genomica, Universitat Pompeu Fabra, Barcelona 08003, Spain) ,  del Pino Manuel M. Sanchez (Departament de Bioquimica i Biologia Molecular, Universitat de Valencia, Burjassot 46100, Spain) ,  Sancho Jaime (ProteoRed-ISCIII, IPBLN (CSIC), Armilla, Granada, Spain) ,  Santamaria Enrique (ProteoRed-ISCIII, Navarrabiomed Biomedical Research Center-IdiSNa, Pamplona, Spain) ,  Vazquez Jesus (ProteoRed-ISCIII, Centro Nacional de Investigaciones Cardiovasculares Carlos III (CNIC), Madrid 28029, Spain) ,  Vilaseca Marta (ProteoRed-ISCIII, Institute for Research in Biomedicine (IRB Barcelona), Barcelona 08028, Spain) ,  Vivanco Fernando (ProteoRed-ISCIII, IIS Fundacion Jimenez Diaz, Madrid, Spain) ,  Walters James J. (MilliporeSigma, St. Louis, MO, USA) ,  Zgoda Victor G. (Orekhovich Institute of Biomedical Chemistry RAMS, Moscow 119121, Russian Federation) ,  Corrales Fernando J. (ProteoRed-ISCIII, CIMA, University of Navarra, Pamplona 31008, Spain) ,  Canals Francesc (ProteoRed-ISCIII, Vall d’Hebron Institute of Oncology (VHIO), Barcelona 08035, Spain) ,  Paradela Alberto (ProteoRed-ISCIII, Centro Nacional de Biotecnologia (CSIC), Madrid 28049, Spain)
資料名： Journal of Proteomics  (Journal of Proteomics)
巻： 152  ページ： 138-149  発行年： 2017年 
JST資料番号： T0073A  ISSN： 1874-3919  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 標的プロテオーム戦略により達成成熟度にもかかわらず,信頼できる標準化されたプロトコルが異なる研究室と分析プラットフォーム間の再現性を向上させるのに必要な,生物医学研究で,より広範囲の使用を促進した。この目標を達成するために,ペプチド標準保持時間(RT)に基づいて定義した,無次元相対保持時間(iRT)の使用は,最近強力なツールとして出現した。この戦略のロバスト性,再現性および有用性を多施設の設定下において初めて調べ,プロテオミクス研究室のスペインのネットワーク(ProteoRed ISCIII)の24を含む28の研究室を含めた。本研究で得られた結果によれば,無次元保持時間値(iRTs)は分子内及び分子間実験室の両方の異なるクロマトグラフィー装置を横切るペプチド保持時間を移動および共有化のための有用なツールであることを示した。iRT値も長期間にわたり非常に低い変動性を示した。さらに,並列定量的分析を用いて,実験戦略,MRM(多重反応モニタリング)またはpseudoMRM,および採用した分析プラットフォームの多様性の品種にもかかわらず,高い再現性を示した。分析科学としてプロテオミクスの非常に初期から結果の最高品質と再現性を確保するために標準化された方法と実験手順の開発に関心が高まっている。これに関連して,無次元保持時間概念の最近(2012年~年)の導入は顕著な進歩した。多中心(28実験室)研究では,標的プロテオミクス実験の文脈におけるこの概念の有用性を検討し,無次元保持時間値は異なるクロマトグラフィー装置を横切るペプチド保持時間を移動および共有化のための有用なツールであることを示した。Copyright 2017 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【Powered by NICT】

シソーラス用語： 標準化 ,  定量的分析 ,  ペプチド ,  *保持比 ,  プロトコル ,  *保持時間 ,  プロテオーム ,  再現性 ,  品種 ,  ロバスト性 ,  熟度 ,  *プロテオミクス ,  スペイン
準シソーラス用語： 多重反応モニタリング ,  共有化 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (7件)： プロテオミクス ,  液体クロマトグラフィー ,  標的プロテオミクス ,  Reproducibility ,  標準化 ,  実験室間検証 ,  多重反応モニタリング

分類 (1件)： 蛋白質・ペプチド一般  (EB03010N)

タイトルに関連する用語 (6件)： 標的 ,  プロテオミクス ,  相対保持 ,  評価 ,  施設 ,  研究