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J-GLOBAL ID：201702283827487312   整理番号：17A0388519

癌におけるその発現変化のヒト銅プロテオームと解析の定義【Powered by NICT】

Defining the human copper proteome and analysis of its expression variation in cancers

著者 (7件)： Blockhuys S. (Department Biology and Biological Engineering, Chalmers University of Technology, Gothenburg, Sweden. [e-mail] [e-mail] [e-mail] [e-mail] [e-mail]) ,  Celauro E. ,  Hildesjoe C. ,  Feizi A. ,  Stal O. ,  Fierro-Gonzalez J. C. ,  Wittung-Stafshede P.
資料名： Metallomics  (Metallomics)
巻： 9  号： 2  ページ： 112-123  発行年： 2017年 
JST資料番号： W2338A  ISSN： 1756-5901  CODEN： METAIR  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 銅(Cu)は生物に必須であり,多くの代謝酵素の補因子として作用する。自由Cuの毒性を避けるために,生物は標的への金属「シャペロン」特異的輸送系を持っている。癌進行は,増加した細胞Cu濃度と関連しており,増殖不死化,血管新生および転移はCuに対して定義された要求と癌特徴である。本研究の目的は,すべての既知の銅結合蛋白質を集め,RNA転写物レベルの利用可能なデータベース資源を用いた癌における推定される関与を明らかにすることである。データベースと共にマニュアルキュレーションを用いて,全54銅結合蛋白質(ヒトCuプロテオームと命名)を同定した。次に,著者らは18の癌タイプでヒトCuプロテオームに対するTCGAデータベースから癌対正常組織におけるRNA発現レベルを検索し,異なる癌における遺伝子の上方制御および下方制御の複雑なパターンを認めた。バイオインフォマティクスと機能的ゲノミクスと組み合わせた階層的クラスタリングは癌関連銅結合蛋白質の予測を可能にした解析これらは乳癌データを検査した。最後に,CuシャペロンATOX1,転写因子活性を有することが提唱のみ銅結合蛋白質であるが,蛋白質レベルでの患者の乳癌組織におけるその予測過剰発現を検証した。,異なる癌におけるRNA発現パターンと,銅結合蛋白質のこの収集は癌におけるCu依存過程の機構的分子研究のための優れた資源として役立つであろう。Copyright 2017 Royal Society of Chemistry All Rights reserved. Translated from English into Japanese by JST【Powered by NICT】

シソーラス用語： 補因子 ,  血管新生 ,  *銅 ,  *プロテオーム ,  アップレギュレーション ,  シャペロンタンパク質 ,  患者 ,  ダウンレギュレーション ,  *ヒト ,  乳房腫瘍 ,  データベース
準シソーラス用語： 過剰発現 ,  ゲノミクス ,  バイオインフォマティクス ,  銅結合蛋白質 , 【Automatic Indexing@JST】

分類 (3件)： 分子構造  (EB03020Y) ,  微生物の生化学  (EG03020N) ,  細胞膜の輸送  (EF04020R)

タイトルに関連する用語 (7件)： 癌 ,  発現 ,  ヒト ,  銅 ,  プロテオーム ,  解析 ,  定義