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J-GLOBAL ID：201702283910486889   整理番号：17A0201167

人气管普胞子胞子におけるMITESトランスポゾンの同定と進化解析【JST・京大機械翻訳】

Characterization and Genomic Evolution of MITEs in Microsporidian Trachipleistophora hominis

著者 (6件)： Liu Lu (School of life sciences,Chongqing Normal University) ,  He Qiang (State Key Laboratory of Silkworm Genome Biology,Southwest University) ,  Chen Shiliang (Sericultural and Apicultural Institute,Yunnan Academy of Agricultural Sciences) ,  Zhang Xiaoyan (School of life sciences,Chongqing Normal University) ,  Zhou Zeyang (School of life sciences,Chongqing Normal University) ,  Xu Jinshan (School of life sciences,Chongqing Normal University)
資料名： Chongqingshifandaxue Xuebao Zirankexueban  (Chongqingshifandaxue Xuebao Zirankexueban)
巻： 33  号： 5  ページ： 12-17  発行年： 2016年 
JST資料番号： C2799A  ISSN： 1672-6693  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： 中国 (CHN)  言語： 中国語 (ZH)

抄録/ポイント： 生物( HOMINIS)の9つのMITESファミリーのTHME1~THME9を,バイオインフォマティクス法により同定し,123のコピーを同定した。MITESの長さは600BP未満であった。標的1( 1)は,標的1(TC1/MARINERスーパーファミリー)に属し,THME2とTHME3はHARBINGERのスーパーファミリーに属している。THME5とTHME6はCACTAスーパーファミリー(スーパーファミリーの名前用全体)に帰属され,他のファミリーは新規ファミリーに分類される。分析によると、人気の胞子虫におけるすべてのMITESファミリーのGIBBS自由エネルギーはいずれも0より小さく、MITESファミリーは二次構造を形成する潜在力を持ち、このファミリーは遺伝子組上転座に有利であることが分かった。人气管普のファミリーファミリーのゲノムへの挿入時間は0~800万年で推定され,またこの挿入はゲノムにおいてランダムであり,位置の偏りがなく,2つのMITESトランスポゾンコピーが遺伝子コード領域に挿入されることを見出した。これらの結果は,胞子の起源と機能の更なる研究のための基礎を提供した。Data from the ScienceChina, LCAS. Translated by JST【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 胞子虫類 ,  遺伝子 ,  *胞子 ,  自由エネルギー ,  転座 ,  *トランスポゾン ,  二次構造 ,  ゲノム
準シソーラス用語： バイオインフォマティクス , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： microsporidia ,  Trachipleistophora hominis ,  MITEs ,  genome ,  transposon

分類 (2件)： 分子構造  (EB03020Y) ,  遺伝子の構造と化学  (EC02020U)

タイトルに関連する用語 (7件)： 人 ,  胞子 ,  Mites ,  トランスポゾン ,  同定 ,  進化 ,  解析