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J-GLOBAL ID：201702283955693348   整理番号：17A0107531

節瓜抗感突然変異体LINEレトロトランスポゾンのRT配列特性解析【JST・京大機械翻訳】

Characterization Analysis of Reverse Transcriptase of LINE Retrotransposons in Chieh-qua Mutants Susceptible and Resistant to Fusaric Acid

著者 (7件)： Zhao Qin (Plant Protection Institute in Jiangsu Academy of Agricultural Science) ,  Xie Dasen (Vegetable Research Institute, Guangdong Academy of Agricultural sciences) ,  He Xiaoming (Vegetable Research Institute, Guangdong Academy of Agricultural sciences) ,  Jiang Biao (Vegetable Research Institute, Guangdong Academy of Agricultural sciences) ,  Luo Shaobo (Vegetable Research Institute, Guangdong Academy of Agricultural sciences) ,  Peng Qingwu (Vegetable Research Institute, Guangdong Academy of Agricultural sciences) ,  Chen Junqiu (Vegetable Research Institute, Guangdong Academy of Agricultural sciences)
資料名： Fenzi Zhiwu Yuzhong  (Fenzi Zhiwu Yuzhong)
巻： 14  号： 8  ページ： 1986-1994  発行年： 2016年 
JST資料番号： C2681A  ISSN： 1672-416X  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： 中国 (CHN)  言語： 中国語 (ZH)

抄録/ポイント： LINE逆転写酵素(RT)の保存配列に従って、縮重プライマーを設計し、PCRによりメロンのGDNAを増幅し、580BPの標的フラグメントを得た。PCR産物をクローン化し,関連するバイオインフォマティクスソフトウェアによって分析し,41のつとそれらの耐性突然変異体からのRT配列を得た。感受性と耐性の配列の長さは,それぞれ,548~590BPと573~590BPであり,ヌクレオチド配列の類似性は,それぞれ,73.6%~98.9%と46.1%~99.3%であった。ヌクレオチド配列のクラスター分析は5つのファミリーに分けられ,ファミリーIは29の配列を含み,メロンのレトロトランスポゾンの主要なファミリーメンバーである。アミノ酸配列の分析により、感受、抗材料はそれぞれ25個と4個の保存アミノ酸を含み、抵抗性突変体半の保存アミノ酸の数は少し少なく、アミノ酸配列の類似性はそれぞれ53.5%~100%と10.3%~100%であることが分かった。抵抗性突然変異体と比較して,感受性品種には,より高い発生率(23,100%)があり,そして,SAMESENSEは,より低い(11,,%)。1つの変異突然変異体配列は転写活性を示した。2つの材料には、高い欠失変異、終止コドンの突然変異とフレームシフト突然変異の発生率があり、高度な異質性を示した。メロンのRT配列と既知の種の相応する配列に系統樹を構築し、メロンの逆転写レトロトランスポゾンのRT配列は比較的保守的で、シロイヌナズナ、ブドウ、李などの近縁関係と近いことが明らかになった。Data from the ScienceChina, LCAS. Translated by JST【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： ヌクレオチド配列 ,  *突然変異 ,  アミノ酸 ,  メロン ,  逆転写 ,  類似性 ,  クローン ,  欠失突然変異 ,  クラスタ分析 ,  不均一性 ,  *レトロトランスポゾン ,  Arabidopsis thaliana ,  アミノ酸配列 ,  系統樹 ,  *変異

著者キーワード (5件)： Chieh-qua ,  Resistant and susceptible mutants to fusaric acid ,  LINE retrotransposons ,  Reverse transcriptase ,  Comparative analysis

分類 (1件)： 微生物生理一般  (EG03051L)

タイトルに関連する用語 (6件)： 節 ,  突然変異体 ,  LINE ,  レトロトランスポゾン ,  RT ,  特性解析