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J-GLOBAL ID：201702284862108262   整理番号：17A0445001

Vibrio parahaemolyticus O4:全ゲノム配列解析により検出されたK8は中国南部における潜在的優勢クローンを形成する【Powered by NICT】

Vibrio parahaemolyticus O4:K8 forms a potential predominant clone in southern China as detected by whole-genome sequence analysis

著者 (7件)： Li Baisheng (Center for Diseases Control and Prevention of Guangdong Province, China) ,  Yang Xingfen (Center for Diseases Control and Prevention of Guangdong Province, China) ,  Tan Hailing (Center for Diseases Control and Prevention of Guangdong Province, China) ,  Ke Bixia (Center for Diseases Control and Prevention of Guangdong Province, China) ,  He Dongmei (Center for Diseases Control and Prevention of Guangdong Province, China) ,  Ke Changwen (Center for Diseases Control and Prevention of Guangdong Province, China) ,  Zhang Yonghui (Center for Diseases Control and Prevention of Guangdong Province, China)
資料名： International Journal of Food Microbiology  (International Journal of Food Microbiology)
巻： 244  ページ： 90-95  発行年： 2017年 
JST資料番号： A0434C  ISSN： 0168-1605  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： Vibrio parahaemolyticusは中国南部で最も一般的な食品媒介病原体,特にO3:K6パンデミッククローンとそのserovariantsされてきた。最近,血清型O4:K8は中国南部でますます一般的になり,これはO3:K6パンデミッククローンとは異なっていた。このように,本研究の目的は,O4:K8の分子特性を解明することであった。O3:K6同じ期間内に単離された流行性クローンとそのserovariantsを比較分析,局所的にまだが支配的であったクローンを選択した。全ゲノムシークエンシング(WGS)は食品由来下痢症例から分離され,血清型O4:K8,O3:K6及びO1:KUT(分類),最近の中国南部で流行している血清型に属する20種類のV.parahaemolyticus株を特性化した。結果は,すべてのこれらの分離株は熱安定性直接ヘモリシン遺伝子(tdh)に陽性であり,一方TDH関連ヘモリシン遺伝子(trh)陰性であった。はV.parahaemolyticus菌株を比較した海外分離した31株およびNCBIゲノムデータベースから入手した。全ゲノムのWGS SNP系統発生分析によると,株は重要な遺伝的系統,O3:K6,O1:KUTと他国際株由来の遺伝的に異なるを形成することを示した。比較ゲノム解析により,全てのO4:K8株は全T3SS-1とVpaI(SS2)領域,O3:K6パンデミッククローンの最も重要な病原性要素を持つことを明らかにした。しかし,全てのO4:K8株は全VpaIとVpaI4つの領域を欠き,VpaIおよびVpaIのわずか数ORF,O3:K6パンデミッククローンに属する1995年の菌株間でユニークなものであると考えられた,を持っていた。著者らのデータは,O4:K8株はO3:K6パンデミッククローン,中国南部の普及ができるかもしれないと類似していた病原性因子を有することを示した。著者らの研究はまた,WGS塩基分析は食品媒介疾患サーベイランスにおけるこの細菌の疫学理解を改善する可能性があることを明らかにした。Copyright 2017 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【Powered by NICT】

シソーラス用語： 血清型 ,  下痢 ,  *中国南部 ,  疫学 ,  溶血素 ,  キャラクタリゼーション ,  *クローン ,  *Vibrio ,  *腸炎ビブリオ ,  *ゲノム ,  系統発生 ,  病原性
準シソーラス用語： 系統解析 ,  菌株 ,  *ゲノム配列 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (4件)： Vibrio parahaemolyticus ,  全ゲノム配列 ,  系統発生解析 ,  SNP

分類 (1件)： 食品の汚染  (FJ01053P)

タイトルに関連する用語 (5件)： Vibrio ,  ゲノム ,  配列解析 ,  中国南部 ,  クローン