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J-GLOBAL ID：201702284989586220   整理番号：17A0169413

乳酸菌のCRISPR-CAS系統の相同性解析【JST・京大機械翻訳】

Homology analysis of CRISPR-Cas system in Lactic acid bacteria

著者 (4件)： Li Wan (Institute of food science,Northeast Agricultural University) ,  Zhang Danqing (Institute of food science,Northeast Agricultural University) ,  Wang Nana (Institute of food science,Northeast Agricultural University) ,  Huo Guicheng (Institute of food science,Northeast Agricultural University)
資料名： Shipin Gongye Keji  (Shipin Gongye Keji)
巻： 37  号： 11  ページ： 134-140,146  発行年： 2016年 
JST資料番号： C2152A  ISSN： 1002-0306  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： 中国 (CHN)  言語： 中国語 (ZH)

抄録/ポイント： CRISPR-CASシステムは乳酸菌のファージなどの外因性遺伝子要素に対する獲得性免疫を提供し、生物情報学方法を利用して、CRISPR配列とCAS遺伝子の乳酸菌種間の相同性関係を分析した。生物情報学的方法を用いて,NCBIにおける配列決定された部分的乳酸菌のCRISPRCAS系統を予測し,反復配列とCAS蛋白質配列について系統発生学的解析を行った。結果は, ,,, と,およびLACTOBACILLUS スイスの標準株が,異なる数のCRISPR-CAS系統を含み,それらの配列は高度に保存され,CAS蛋白質の配列相同性が高いことを示した。CRISPR-CAS系の相同性はその亜型と密接に関連しており,菌種との関係に大きな違いがあり,CRISPR-CAS系が遺伝子レベルで伝播することができることを証明した。Data from the ScienceChina, LCAS. Translated by JST【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 遺伝子 ,  スイス連邦 ,  *相同性 ,  配列相同性 ,  バクテリオファージ ,  タンパク質 ,  *乳酸菌
準シソーラス用語： 系統学 ,  NCBI ,  バイオインフォマティクス ,  *CRISPR配列 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： Lactic acid bacteria ,  clustered regularly interspaced short palindromic repeats(CRISPR) ,  homology ,  repeats ,  spacers

分類 (1件)： 遺伝子の構造と化学  (EC02020U)

タイトルに関連する用語 (4件)： 乳酸菌 ,  系統 ,  相同性 ,  解析