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J-GLOBAL ID：201702286387633619   整理番号：17A0534635

桂のEST資源のSSR情報分析とEST-SSRマーカーの開発【JST・京大機械翻訳】

SSR Information Analysis of Curcuma kwangsiensis EST Resources and EST-Development of SSR Markers

著者 (4件)： Jin Yahui (College of Pharmacy,Guangxi University of Chinese Medicine) ,  Su Weimin (College of Pharmacy,Guangxi University of Chinese Medicine) ,  Yang Ni (College of Pharmacy,Guangxi University of Chinese Medicine) ,  Wang Jian (College of Pharmacy,Guangxi University of Chinese Medicine)
資料名： Zhongguo Shiyan Fangji Xue Zazhi  (Zhongguo Shiyan Fangji Xue Zazhi)
巻： 22  号： 24  ページ： 37-42  発行年： 2016年 
JST資料番号： C3085A  ISSN： 1005-9903  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： 中国 (CHN)  言語： 中国語 (ZH)

抄録/ポイント： 目的;桂 ウコンのESTのSSR遺伝子座の分布パターンを分析し、桂のEST-SSRプライマーを開発し、EST-SSRが桂郁金品種の遺伝的多様性に用いる可能性を検討した。方法;NCBIデータベースからウコン属のEST配列(EXPRESSED SEQUENCE TAG,EST)12個をダウンロードし、MISAソフトウェアを利用してSSR遺伝子座の検索を行い、条件に符合する配列を選出した。EST-SSRプライマーをプライマー5.0ソフトウェアによって設計し,これらのEST-SSRプライマーのPCR増幅特性をポリアクリルアミドゲル電気泳動(PAGE)によって研究し,開発結果の合理性と有効性を検証した。【結果】;得られた12のEST配列のうち、926の配列はSSR遺伝子座を含み、全体のESTデータベースの7.30%を占め、その中のSSR遺伝子座の割合が最も大きいのはジヌクレオチド反復配列であり、トリヌクレオチドとそれらは,それぞれ623(50.90),388(31.70)および125(%)であった。165のEST-SSRプライマー対を選択し,92の以上の24の合成を選択した。PCR分析により、21のプライマー対(87.50%)は安定した明確なベルト型を増幅できることが分かった。13のEST-SSRプライマーは6つの異なる種質桂のウコンの中で検出され,設計されたプライマーの%%を占めた。13対のEST-SSRプライマーを用いて,20の桂品種の遺伝的関係を分析した。結論;桂のEST-SSRマーカーの開発効率は高く、桂のSSRマーカー開発の重要な措置であり、桂郁金の品種同定と遺伝的多様性の分析及び育種などに対して重要な意義がある。Data from the ScienceChina, LCAS. Translated by JST【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： データベース ,  ソフトウェア ,  *ウコン ,  PCR法 ,  品種 ,  ウコン属 ,  遺伝
準シソーラス用語： *マイクロサテライトマーカー ,  トリヌクレオチド ,  ESTデータベース ,  EST配列 ,  NCBI ,  遺伝多様性 ,  *EST-SSR ,  情報分析 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (4件)： Curcuma kwangsiensis ,  expressed sequence tag ,  simple sequence repeat ,  primers development

分類 (3件)： 遺伝子の構造と化学  (EC02020U) ,  麦  (FC03033M) ,  集団遺伝学  (EC01040J)

タイトルに関連する用語 (5件)： EST ,  資源 ,  SSR ,  情報分析 ,  開発