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J-GLOBAL ID：201702288226585054   整理番号：17A0077914

多剤耐性大腸菌NB8株の全ゲノム組耐薬遺伝子の検出【JST・京大機械翻訳】

Genes in multi-drug resistant Escherichia coli NB8 by whole genome sequencing

著者 (4件)： Weng Xingbei (Department of Medical Laboratory,Ningbo First Hospital) ,  Mi Zuhuang (Department of Bioinformation,Wuxi Clon-Gen Techonology Institute) ,  Wang Chunxin (Department of Medical Laboratory,Wuxi People’s Technology Hospital affiliated to Nanjing Medical University) ,  Zhu Jianming (Department of Medical Laboratory,Hangzhou Yuhang Hospital of traditional Chinese Medicine)
資料名： Zhongguo Renshougonghuanbing Xuebao  (Zhongguo Renshougonghuanbing Xuebao)
巻： 32  号： 8  ページ： 741-745  発行年： 2016年 
JST資料番号： C2253A  ISSN： 1002-2694  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： 中国 (CHN)  言語： 中国語 (ZH)

抄録/ポイント： 【目的】1つの多剤耐性大腸菌NB8株の遺伝的背景を検出する。方法:病原体分離は2012年4月に寧波市第一病院の入院患者の尿液に行い、16S RDNAとGYRA遺伝子のシークエンシング、BLASTNの比較により大腸菌と確認した。ILLUMINA HISEQとION TORRENT PGMの2種類の大規模並列並列を用いて全ゲノム解析を行い、さらに人工シークエンシングを行った。最後にNB8株と9株が全ゲノム配列決定を行った大腸菌中遺伝子の比較ゲノム学的研究を行った。結果:多剤耐性大腸菌NB8株の全ゲノム配列により推定された染色体配列が得られ、長さは4550369BP(14個の切欠きを含む)であり、一つの推定されたプラスミド配列が得られ、長さは635377BP(33個の切欠きを含む)であった。NB8株の全ゲノムデータからΒ-ラクタム類,アミノ配糖体類,キノロン類,マクロライド類,スルホンアミド類,テトラサイクリン類,ポリミキシン類の耐性遺伝子を発掘し,接合プラスミド,トランスポゾン,挿入配列,インテグロンの遺伝マーカー,および5大排出ポンプ遺伝子をマイニングした。結論:多剤耐性大腸菌NB8株の遺伝学的背景は明らかになり、能動排出機序の増強もNB8株の薬剤耐性を増強あるいは増強することができる。プラスミド,トランスポゾン及びインテグロンなどの可動性遺伝要素は細菌の薬剤耐性を迅速に伝播させ,受容を多剤耐性として表現することができる。Data from the ScienceChina, LCAS. Translated by JST【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： *遺伝 ,  トランスポゾン ,  *大腸菌 ,  テトラサイクリン類 ,  挿入配列 ,  *ゲノム ,  遺伝学 ,  薬物耐性 ,  プラスミド ,  *多剤耐性 ,  スルホンアミド
準シソーラス用語： 遺伝子マーカ ,  インテグロン ,  耐性遺伝子 ,  ゲノム配列 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (6件)： Escherichia coli ,  whole genome ,  multi-drug resistance ,  resistant gene ,  mobile genetic element ,  efflux pump gene

分類 (2件)： 分子・遺伝情報処理  (JE15040B) ,  遺伝子の構造と化学  (EC02020U)

タイトルに関連する用語 (4件)： 多剤耐性 ,  大腸菌 ,  ゲノム ,  遺伝子