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J-GLOBAL ID：201702290422137109   整理番号：17A0101188

ブロイラーの回腸微生物多様性とPICRUST遺伝子の予測分析をハイスループットに基づいて行った。【JST・京大機械翻訳】

Analyzing of Ileum Microbial Diversity of Chickens by High-Throughput Sequencing and PICRUSt Predicted

著者 (6件)： Xu Shuai (Animal Microecology Institute, College of Veterinary Medicine, Sichuan Agricultural University) ,  Lin Yicen (Animal Microecology Institute, College of Veterinary Medicine, Sichuan Agricultural University) ,  Zhou Mengjia (Animal Microecology Institute, College of Veterinary Medicine, Sichuan Agricultural University) ,  Ni Xueqin (Animal Microecology Institute, College of Veterinary Medicine, Sichuan Agricultural University) ,  Zeng Dong (Animal Microecology Institute, College of Veterinary Medicine, Sichuan Agricultural University) ,  Zeng Yan (Animal Microecology Institute, College of Veterinary Medicine, Sichuan Agricultural University)
資料名： Dongwu Yingyang Xuebao  (Dongwu Yingyang Xuebao)
巻： 28  号： 8  ページ： 2581-2588  発行年： 2016年 
JST資料番号： C2679A  ISSN： 1006-267X  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： 中国 (CHN)  言語： 中国語 (ZH)

抄録/ポイント： 本試験は健康なブロイラーの回腸の微生物群集構造と機能を研究することを目的とした。15羽の鶏の回腸内容物をハイスループット配列決定法により配列決定し,97%の類似度で操作分類ユニット(OTUS)を分類し,配列数の少ないOTUS(N<2)を除去し,次にバイオインフォマティクス解析およびPICRUST遺伝子予測を行った。結果は以下を示す。1)合計424のつのTAGSが得られ,1のないに分類され,平均試料は(28±8)であり,平均OTUSは(261±82)であった。2)すべての試料には20個の門脈,160個の属が含まれている。それらの間で,4つのコアは,それぞれFIRMICUTES(85.35%),変形(6.09%),シアノバクテリア門(2.15%),および放線菌(0.16%)であった。19種の核種を共有し,全サンプルの93.75%を占めた。3)ニワトリ回腸試料は328個の機能を予測した。前20個の機能熱図から,各試料の有効性に差があることが分かった。これらのことから,鶏回腸微生物群集は複雑であるが,主要菌群は比較的安定していることが示唆された。本研究は鶏の回腸微生物群集構造と機能の更なる研究に参考を提供した。Data from the ScienceChina, LCAS. Translated by JST【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： *回腸 ,  門脈 ,  藍藻類 ,  遺伝子 ,  *ブロイラー ,  放線菌類
準シソーラス用語： 微生物コンソーシアム ,  バイオインフォマティクス ,  類似度 ,  微生物群集構造 ,  健康 ,  *ハイスループット ,  *微生物多様性 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： chicken ,  ileum ,  high-throughput sequencing ,  core-microbiome ,  PICRUSt

分類 (4件)： 遺伝子発現  (EC02040Q) ,  微生物の生態  (EG03040J) ,  遺伝学研究法  (EC01020N) ,  生物学的機能  (EB03040U)

タイトルに関連する用語 (7件)： ブロイラー ,  回腸 ,  微生物多様性 ,  遺伝子 ,  予測 ,  分析 ,  ハイスループット