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J-GLOBAL ID：201702291007321551   整理番号：17A0300718

シュートEST-SSRマーカーの開発と遺伝的多様性解析への応用【JST・京大機械翻訳】

Development of EST-SSR Molecular Marker and Its Application in Genetic Diversity Analysis of Oncidium

著者 (4件)： Lin Rongyan (Crop Research Institute, Fujian Academy of Agricultural Sciences, Fujian Engineering Research Center for Characteristic Floriculture) ,  Zhong Huaiqin (Crop Research Institute, Fujian Academy of Agricultural Sciences, Fujian Engineering Research Center for Characteristic Floriculture) ,  Huang Minling (Crop Research Institute, Fujian Academy of Agricultural Sciences, Fujian Engineering Research Center for Characteristic Floriculture) ,  Luo Yuanhua (Crop Research Institute, Fujian Academy of Agricultural Sciences, Fujian Engineering Research Center for Characteristic Floriculture)
資料名： Fenzi Zhiwu Yuzhong  (Fenzi Zhiwu Yuzhong)
巻： 14  号： 11  ページ： 3113-3119  発行年： 2016年 
JST資料番号： C2681A  ISSN： 1672-416X  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： 中国 (CHN)  言語： 中国語 (ZH)

抄録/ポイント： 本研究はNCBIデータベース中のシュートのEST配列に基づき、そのEST-SSRマーカーに対して分析を行い、そして20対のEST-SSRプライマーを30個のシュート品種の遺伝的多様性の分析研究に設計した。3のEST配列を検索し,274のSSR遺伝子座を検出し,検出率は8.61%であった。ジヌクレオチド反復型は,シュート%のEST-SSRの主要な反復型であった。13対のプライマーはPCR増幅により増幅され,10対のプライマー対は10の多型バンドを示し,各プライマーの多型率は75.00%~100.00%であり,多型情報の変化範囲は0.69~0.93であった。クラスター分析により、30のシュート品種間の遺伝距離の変化は0.04~0.58であり、しかも遺伝距離が0.39の場合、30のシュート品種を7つのクラスターに分けることができることが分かった。Data from the ScienceChina, LCAS. Translated by JST【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： PCR法 ,  *品種 ,  クラスタ分析 ,  データベース ,  クラスタ
準シソーラス用語： 遺伝距離 ,  検出率 ,  EST配列 ,  NCBI ,  *遺伝多様性 ,  *EST-SSR , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (4件)： Oncidium ,  EST-SSR ,  Polymorphism ,  Genetic diversity

分類 (2件)： 遺伝子の構造と化学  (EC02020U) ,  麦  (FC03033M)

タイトルに関連する用語 (5件)： シュート ,  開発 ,  遺伝的多様性 ,  解析 ,  応用