研究者
J-GLOBAL ID：201201004912271535   更新日: 2024年04月17日

清水 厚志

シミズ アツシ | Shimizu Atsushi
所属機関・部署：
岩手医科大学 医歯薬総合研究所 生体情報解析部門

岩手医科大学 医歯薬総合研究所 生体情報解析部門 について


職名： 教授
その他の所属（所属・部署名・職名） (5件)：
  • 岩手医科大学  いわて東北メディカル・メガバンク機構 
  • 岩手医科大学  医歯薬総合研究所 ゲノム・オミックス解析支援センター 
  • 国立遺伝学研究所  日本DNAデータバンク 
  • 慶應義塾大学  医学部 衛生学公衆衛生学教室   特任教授
  • 東北大学  東北メディカル・メガバンク機構 
ホームページURL (2件)： http://iwate-megabank.org ,  http://researchmap.jp/atsushi_ngs/
研究分野 (4件)： ゲノム生物学 ,  システムゲノム科学 ,  医化学 ,  胎児医学、小児成育学
研究キーワード (6件)： バイオインフォマティクス ,  次世代シークエンサー ,  疫学 ,  遺伝医学 ,  ゲノム医学 ,  Molecular genetics
競争的資金等の研究課題 (27件)：
  • 2023 - 2028 NCDs・フレイル予防の共通経路としての代謝物バイオマーカーの有用性評価と検証
  • 2022 - 2028 コホート・生体試料支援プラットフォーム
  • 2023 - 2026 臍帯血ゲノム・エピゲノムによる小児肥満複合リスク予測モデルの開発と検証
  • 2022 - 2026 心理的形質から全死亡に至る因果経路に関する網羅的メンデルランダム化研究
  • 2022 - 2026 ヒトの網羅的解析とその統合解析による新型たばこの疾患リスクの早期評価とその展開
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論文 (164件)：
  • Asahi Hishida, Masahiro Nakatochi, Yoichi Sutoh, Shiori Nakano, Yukihide Momozawa, Akira Narita, Kozo Tanno, Atsushi Shimizu, Atsushi Hozawa, Kengo Kinoshita, et al. GWAS meta-analysis of kidney function traits in Japanese populations. Journal of epidemiology. 2024
  • Tomoharu Tokutomi, Akiko Yoshida, Akimune Fukushima, Kayono Yamamoto, Yasushi Ishigaki, HIROSHI KAWAME, Nobuo Fuse, Fuji Nagami, Yoichi Suzuki, Mika Sakurai-Yageta, et al. The Health History of First-Degree Relatives’ Dyslipidemia Can Affect Preferences and Intentions following the Return of Genomic Results for Monogenic Familial Hypercholesterolemia. Genes. 2024
  • Harutomo Numazaki, Takahito Nasu, Mamoru Satoh, Yuka Kotozaki, Kozo Tanno, Koichi Asahi, Hideki Ohmomo, Atsushi Shimizu, Shinichi Omama, Yoshihiro Morino, et al. Association between vascular endothelial dysfunction and stroke incidence in the general Japanese population: Results from the tohoku medical megabank community-based cohort study. International Journal of Cardiology Cardiovascular Risk and Prevention. 2023. 19. 200216-200216
  • Sei Harada, Hideki Ohmomo, Minako Matsumoto, Mizuki Sata, Miho Iida, Aya Hirata, Naoko Miyagawa, Kazuyo Kuwabara, Suzuka Kato, Ryota Toki, et al. Metabolomics profiles alterations in cigarette smokers and heated tobacco product users. Journal of epidemiology. 2023
  • Shu Tadaka, Junko Kawashima, Eiji Hishinuma, Sakae Saito, Yasunobu Okamura, Akihito Otsuki, Kaname Kojima, Shohei Komaki, Yuichi Aoki, Takanari Kanno, et al. jMorp: Japanese Multi-Omics Reference Panel update report 2023. Nucleic acids research. 2023
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MISC (198件)：
  • Yunye He, Masaru Koido, Yoichi Sutoh, Mingyang Shi, Yayoi Otsuka-Yamasaki, Hans Markus Munter, Takayuki Morisaki, Akiko Nagai, Yoshinori Murakami, Chizu Tanikawa, et al. East Asian-specific and cross-ancestry genome-wide meta-analyses provide mechanistic insights into peptic ulcer disease. medRxiv. 2022
  • 清水厚志. ヒトゲノム完全配列決定 --なぜヒトゲノム計画完了宣言から完全配列決定まで20年かかったか. 科学. 2022. 92. 8. 692-696
  • 清水 厚志. 出生コホート連携 ゲノムコホート研究におけるIPDメタ解析の取り組み. 日本衛生学雑誌. 2022. 77. Suppl. S117-S117
  • 八谷 剛史, 清水 厚志. 【最新臨床脳卒中学(第2版)上-最新の診断と治療-】危険因子 遺伝要因. 日本臨床. 2022. 80. 増刊1 最新臨床脳卒中学(上). 333-338
  • 小巻翔平, 清水厚志, 清水厚志. ゲノム医療におけるデータベース-使い方とコツ 1.一般集団・多因子疾患関連バリアントのデータベース 2)iMETHYL. 遺伝子医学. 2022. 12. 1. 20-23
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特許 (2件)：
  • 腎細胞癌の診断マーカー及びそれを用いた診断方法
  • 脳梗塞発症リスクの予測モデル作成方法および予測方法
書籍 (7件)：
  • がんゲノムデータ解析
    メディカルサイエンスインターナショナル 2022 ISBN:4815730520
  • 次世代シークエンサーDRY解析教本
    学研メディカル秀潤社 2019 ISBN:478090983X
  • 実験医学増刊 Vol.35 No.17 ヒト疾患のデータベースとバイオバンク〜情報をどう使い、どう活かすか?ゲノム医療をどう実現するか?
    羊土社 2017 ISBN:4758103666
  • 次世代シークエンサーDRY解析教本 (細胞工学別冊)
    学研メディカル秀潤社 2015 ISBN:4780909201
  • 実験医学別冊「次世代シークエンス解析スタンダード」ヒトゲノム・オミックス情報のコホート研究への応用.
    羊土社 2014
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講演・口頭発表等 (125件)：
  • 脳梗塞のゲノム疫学研究
    (第54回日本動脈硬化学会総会・学術集会 2022)
  • ポリジェニックリスクスコアのがん予防や治療への実装と課題
    (日本人類遺伝学会第66回大会 第28回日本遺伝子診療学会大会 合同開催 2021)
  • 大規模ゲノムコホート連携と遺伝情報を活用した疾患発症リスク予測モデルによる個別化予防の実現
    (第123回 慶應義塾大学医学部生涯教育研修セミナー 2021)
  • いわて東北メディカル・メガバンク機構(IMM)におけるコホート検体の複合オミックス解析
    (慶應義塾大学 システム医療研究開発センター セミナー 2016)
  • ヒトゲノム情報を活用した次世代型予防医療の実現に向けて
    (成育医療センター特別セミナー 2016)
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学歴 (2件)：
  • 1994 - 1999 青山学院大学 大学院理工学研究科 化学専攻
  • 1900 - 1994 青山学院大学 理工学部 化学・生命科学科
学位 (1件)：
  • 博士(理学) (青山学院大学)
経歴 (13件)：
  • 2022/04 - 現在 国立遺伝学研究所 生命情報・DDBJセンター 特命教授
  • 2020/05 - 現在 東北大学 東北メディカル・メガバンク機構
  • 2020/01 - 現在 岩手医科大学 医歯薬総合研究所生体情報解析部門 教授
  • 2019/08 - 現在 慶應義塾大学 医学部 衛生学公衆衛生学教室 特任教授
  • 2013/04 - 2024/03 慶應義塾大学 医学部 生理学教室
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委員歴 (4件)：
  • 2022/01 - 現在 日本疫学会疫学 リソース利用促進委員会リンケージ基盤推進ワーキンググループ委員
  • 2019/11 - 現在 日本人類遺伝学会 利益相反委員会委員
  • 2019/11 - 現在 日本人類遺伝学会 評議員
  • 2018/04 - 2020/03 日本バイオインフォマティクス学会 理事
所属学会 (9件)：
NGS現場の会 ,  日本オミックス医療学会 ,  日本エピジェネティクス研究会 ,  慶應医学会 ,  日本分子生物学会 ,  米国人類遺伝学会 ,  日本遺伝子診療学会 ,  日本人類遺伝学会 ,  日本遺伝カウンセリング学会
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