研究者
J-GLOBAL ID:201201082893633847   更新日: 2024年02月01日

丹生 智也

タンジョウ トモヤ | Tanjo Tomoya
所属機関・部署:
職名: 特任教員
その他の所属(所属・部署名・職名) (1件):
  • 国立遺伝学研究所  生命情報・DDBJセンター   特任教員
研究分野 (1件): 計算機システム
競争的資金等の研究課題 (2件):
  • 2015 - 2018 状態空間モデルに基づく統計的アクセス制御手法の研究
  • 2012 - 2015 命題論理の推論技術を用いた高性能かつ柔軟な制約プログラミングシステムの実現
論文 (54件):
  • Takeshi Ara, Yuichi Kodama, Toshiaki Tokimatsu, Asami Fukuda, Takehide Kosuge, Jun Mashima, Yasuhiro Tanizawa, Tomoya Tanjo, Osamu Ogasawara, Takatomo Fujisawa, et al. DDBJ update in 2023: the MetaboBank for metabolomics data and associated metadata. Nucleic acids research. 2023
  • 大江 和一, 竹房 あつ子, 丹生 智也, 合田 憲人. クラウド環境構築システムVCPによるmdxでのスケーラブルなHPCクラスタの構築. 情報処理学会研究報告(Web). 2023. 2023-HPC-190. 9. 1-7
  • Yasuhiro Tanizawa, Takatomo Fujisawa, Yuichi Kodama, Takehide Kosuge, Jun Mashima, Tomoya Tanjo, Yasukazu Nakamura. DNA Data Bank of Japan (DDBJ) Update Report 2022. Nucleic Acids Research. 2022. 51. D1. D101-D105
  • Kumiko Kobayashi, Hiroshi Yoshida, Tomoya Tanjo, Kento Aida. Cloud Service Checklist for Academic Communities and Customization for Genome Medical Research. 2022. 9. 1
  • Hirotaka Suetake, Tomoya Tanjo, Manabu Ishii, Bruno P. Kinoshita, Takeshi Fujino, Tsuyoshi Hachiya, Yuichi Kodama, Takatomo Fujisawa, Osamu Ogasawara, Atsushi Shimizu, et al. Sapporo: A Workflow Execution Service that Encourages the Reuse of Workflows in Various Languages in Bioinformatics. 2022. 11. 889-889
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書籍 (2件):
  • 「特集」スパコン・クラウドを生命科学に使う/がん遺伝子パネル
    羊土社 2022 ISBN:9784758125543
  • 次世代シークエンサーDRY解析教本
    学研メディカル秀潤社 2019 ISBN:9784780909838
講演・口頭発表等 (42件):
  • Web 型プログラミング演習環境のハイブリットクラウド運用に向けた調査,及びOCS テンプレート開発
    (大学ICT推進協議会 2023年度年次大会 2023)
  • 日本のデータベースの未来を語る
    (2023年日本バイオインフォマティクス学会年会 第12回生命医薬情報学連合大会 (IIBMP2023) 2023)
  • cwl-d: CWL parser for D
    (The CWL 2023 Conference 2023)
  • クラウド環境構築システム VCP ポータブル版の開発と活用事例の紹介
    (大学ICT推進協議会 2022年度年次大会 (AXIES2022) 2022)
  • 内部状態遷移モデルの変更により機能拡張可能なワークフロー実行処理系の実現に向けて
    (第137回プログラミング研究発表会 2022)
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Works (11件):
  • cwl-d-auto: Autogenerated classes for reading and writing CWL objects using the D language
    Tomoya Tanjo 2022 - 現在
  • shaft: A workflow engine for CWL CommandLineTool
    丹生 智也 2022 - 現在
  • schema-salad-d: Salad validator library written in D
    丹生 智也 2021 - 現在
  • medal: A workflow engine based on Petri nets
    丹生 智也 2020 - 現在
  • zatsu-cwl-generator: Simple CWL document generator from given execution commands
    石井 学, 丹生 智也 2020 - 現在
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学歴 (4件):
  • 2009 - 2012 神戸大学 大学院工学研究科 情報知能学専攻
  • 2007 - 2009 神戸大学 大学院工学研究科 情報知能学専攻
  • 2003 - 2007 神戸大学 工学部 情報知能工学科
  • 2000 - 2003 長野県松本深志高等学校
学位 (2件):
  • 修士(工学) (神戸大学)
  • 博士(工学) (神戸大学)
経歴 (9件):
  • 2023/07 - 現在 国立遺伝学研究所 生命情報・DDBJセンター 特任教員
  • 2023/07 - 現在 データサイエンス共同利用基盤施設 バイオデータ研究拠点 特任准教授
  • 2021/06 - 現在 国立情報学研究所 クラウド基盤研究開発センター 客員助教
  • 2021/05 - 現在 独立行政法人国立国際医療研究センター 客員研究員
  • 2021/04 - 2023/06 国立遺伝学研究所 生命情報・DDBJ研究センター 特任助教
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委員歴 (4件):
  • 2023/09 - 現在 The 2024 CWL Conference Organizer
  • 2023/01 - 現在 Core Challenge 2023 Organizer
  • 2022/04 - 現在 Common Workflow Language Technical Team
  • 2022/12 - 2023/09 The 7th cross-disciplinary Workshop on Computing Systems, Infrastructures, and Programming (xSIG 2023) プログラム幹事
所属学会 (3件):
情報処理学会 ,  人工知能学会 ,  日本ソフトウェア科学会
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