- 2021 - 2024 倍数化を伴わない交雑種分化による生殖隔離と多様化の検証
- 2021 - 2022 森林生態系機能における種内多様性の生態学的意義の検証
- 2020 - 2021 気候変動に対する適応的応答プロセスの遺伝的基盤の解明
- 2020 - 2021 希少種を含むイカリソウ属の系統分類学的研究
- 2017 - 2021 近縁な種間でみられる収斂進化の遺伝的基盤
- 2019 - 2020 西日本に多様に分化するイカリソウ属における種分化の維持機構に関する研究
- 2013 - 2016 迅速な適応を可能にする遺伝子変異の由来の判定
- 2012 - 2015 植物の対照的適応戦略に関する次世代分子生態学(分担)
- 2013 - 2014 温帯性および亜熱帯性植物の適応分化と遺伝子流動に関する研究
- 2011 - 2014 東アジア原産観賞植物の栽培化と野生化に関する保全生物学的研究 (分担)
- 2010 - 2013 異なる環境に適応分化する2種間の遺伝子浸透とニッチ変化過程の解明
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