研究者
J-GLOBAL ID：201301036864119951   更新日: 2024年03月04日

松本 篤幸

マツモト シゲユキ | Matsumoto Shigeyuki
所属機関・部署：
京都大学

京都大学 について


職名： 特定准教授
研究分野 (1件)： 構造生物化学
競争的資金等の研究課題 (5件)：
  • 2022 - 2026 深層学習技術を用いた動的情報からの化合物ータンパク質結合親和性の抽出
  • 2022 - 2025 cryoEM-NMR融合構造解析の確立
  • 2017 - 2022 がん遺伝子産物Rasの動的な構造特性を介した機能発現メカニズムの解明
  • 2014 - 2017 低分子量G蛋白質Rasの翻訳後脂質修飾の役割の構造科学的研究
  • 2014 - 2017 創薬への応用に向けたrasがん遺伝子産物の構造ダイナミクスの分子機構の解明
論文 (31件)：
  • Mai Suzuki, Ken Uchibori, Tomoko Oh-hara, Yumi Nomura, Ryusei Suzuki, Ai Takemoto, Mitsugu Araki, Shigeyuki Matsumoto, Yukari Sagae, Mutsuko Kukimoto-Niino, et al. A macrocyclic kinase inhibitor overcomes triple resistant mutations in EGFR-positive lung cancer. npj Precision Oncology. 2024
  • Takuto Koyama, Hayato Tsumura, Shigeyuki Matsumoto, Ryunosuke Okita, Ryosuke Kojima, Yasushi Okuno. ChemGLaM: Chemical-Genomics Language Models for Compound-Protein Interaction Prediction. 2024
  • Fumi Shima, Yoko Yoshikawa, Yoshiteru Makino, Hirokazu Kubota, Takashi Kawamura, Shigeyuki Matsumoto, Hitomi Yuki, Akira Shibaike, Megumi Okamura, Tomoyo Okada, et al. Small-molecule RAS/RAF Binding Inhibitors Allosterically Disrupt RAF Conformation and Exert Efficacy Against a Broad Spectrum of RAS-driven Cancers. 2024
  • Yoshinobu Igarashi, Ryosuke Kojima, Shigeyuki Matsumoto, Hiroaki Iwata, Yasushi Okuno, Hiroshi Yamada. Developing a GNN-based AI model to predict mitochondrial toxicity using the bagging method. The Journal of Toxicological Sciences. 2024. 49. 3. 117-126
  • Hiroaki Iwata, Taichi Nakai, Takuto Koyama, Shigeyuki Matsumoto, Ryosuke Kojima, Yasushi Okuno. VGAE-MCTS: A New Molecular Generative Model Combining the Variational Graph Auto-Encoder and Monte Carlo Tree Search. Journal of Chemical Information and Modeling. 2023
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MISC (6件)：
  • Shigeyuki Matsumoto, Haruka Taniguchi-Tamura, Mitsugu Araki, Takashi Kawamura, Ryo Miyamoto, Chiemi Tsuda, Yasushi Okuno, Fumi Shima, Takashi Kumasaka, Tohru Kataoka. Novel Insights into the Structural Perturbation Induced by the Oncogenic Mutations, Q61L and Q61H, in Ras State 1. BIOPHYSICAL JOURNAL. 2020. 118. 3. 42A-42A
  • 佐伯茉帆, 槇野義輝, 松本篤幸, 河村高志, 南後恵理子, 熊坂崇, 島扶美. SACLA,SPring-8並びにNMRを用いた低分子量Gタンパク質RasのGTP加水分解過程における動的構造解析. 日本分子生物学会年会プログラム・要旨集(Web). 2020. 43rd
  • 宮口郁子, 鹿島亜季子, 佐藤美和, 中田一人, 馬彪, 松本篤幸, 徳久淳師, 大田雅照, 池口満徳. AI用学習データ作成のための高・低分解能の蛋白質結晶構造比較. 日本細胞生物学会大会(Web). 2019. 71st
  • 馬場剛史, 小甲裕一, 佐藤美和, 中川寛之, 宮口郁子, MA Biao, 松本篤幸, 徳久淳師, 大田雅照, 池口満徳, et al. 3D-CNNを活用したポケット予測に関する研究。. 構造活性相関シンポジウム講演要旨集. 2019. 47th (CD-ROM)
  • 松本篤幸, 荒木望嗣, 井阪悠太, 奥野恭史, 奥野恭史. 分子動力学計算を用いたアルデヒド脱水素酵素2(ALDH2)非活性型変異体の動的立体構造特性の解析. 日本細胞生物学会大会(Web). 2019. 71st
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特許 (1件)：
  • Ras/Raf結合阻害化合物
書籍 (5件)：
  • 大規模MD計算によるCOVID-19治療薬探索
    北隆館 2023
  • クライオ電子顕微鏡計測データからタンパク質の柔らかさを推定するAIシステム「DEFMap」の開発
    エヌ・ティー・エヌ 2023 ISBN:9784860438043
  • AI・シミュレーションによる薬剤開発の迅速化
    羊土社 2022
  • rasがん遺伝子産物Rasを分子標的としたがん治療薬開発の現状
    2014
  • The Enzymes, Vol. 34, Inhibitors of the Ras superfamily G-proteins, Part B / Discovery of Small-Molecule Ras Inhibitors that Display Antitumor Activity by Interfering with Ras・GTP?Effector Interaction
    Elsevier Inc. 2013
講演・口頭発表等 (14件)：
  • 計算科学的アプローチによる実践的なタンパク質-化合物相互作用評価
    (第97回日本薬理学会年会 2023)
  • Iterative Data Augmentation of near boundary negative samples Compound-Protein Interaction Prediction
    (Intelligent Systems for Molecular Biology/European Conference on Computational Biology (ISMB/ECCB) 2023)
  • 生命科学におけるAI・シミュレーション・実験融合. メディカルAIコース
    (メディカルAI 2022)
  • MDシミュレーションと機械学習技術の融合によるcryo-EM密度マップからのタンパク質動的情報の抽出
    (MOEフォーラム2022 2022)
  • 機械学習技術と分子動力学計算を用いたcryo-EMマップからのタンパク質運動性情報の抽出
    (第60回日本生物物理学会年会 2022)
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学歴 (1件)：
  • - 2009 大阪大学 大学院薬学研究科博士後期課程修了
学位 (2件)：
  • 修士(薬学) (大阪大学)
  • 博士(薬学) (大阪大学)
受賞 (3件)：
  • 2022/10 - CBI学会 ポスター賞
  • 2022/10 - CBI学会 ポスター賞
  • 2022/06 - 日本蛋白質科学会 若手奨励賞
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