大上雅史

オオウエマサヒト | Ohue Masahito

所属機関・部署：
職名：准教授
ホームページURL (2件)： http://www.li.c.titech.ac.jp , http://goo.gl/Y4LG1

研究分野 (2件)：生物物理学 , 生命、健康、医療情報学

研究キーワード (5件)：高性能計算 , ケモインフォマティクス , 生命情報科学 , タンパク質間相互作用 , バイオインフォマティクス

競争的資金等の研究課題 (17件)：

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論文 (69件)：

Masahito Ohue, Yuki Kojima, Takatsugu Kosugi. Generating Potential Protein-Protein Interaction Inhibitor Molecules Based on Physicochemical Properties. Molecules (Basel, Switzerland). 2023. 28. 15
Jianan Li, Keisuke Yanagisawa, Masatake Sugita, Takuya Fujie, Masahito Ohue, Yutaka Akiyama. CycPeptMPDB: A Comprehensive Database of Membrane Permeability of Cyclic Peptides. Journal of chemical information and modeling. 2023. 63. 7. 2240-2250
Jessica Andreani, Brian Jiménez-García, Masahito Ohue. Editorial: Web tools for modeling and analysis of biomolecular interactions Volume II. Frontiers in molecular biosciences. 2023. 10. 1190855-1190855
Masatake Sugita, Takuya Fujie, Keisuke Yanagisawa, Masahito Ohue, Yutaka Akiyama. Lipid Composition Is Critical for Accurate Membrane Permeability Prediction of Cyclic Peptides by Molecular Dynamics Simulations. Journal of chemical information and modeling. 2022. 62. 18. 4549-4560
Keisuke Yanagisawa, Rikuto Kubota, Yasushi Yoshikawa, Masahito Ohue, Yutaka Akiyama. Effective Protein-Ligand Docking Strategy via Fragment Reuse and a Proof-of-Concept Implementation. ACS omega. 2022. 7. 34. 30265-30274

MISC (60件)：

大上雅史. AIによって変わる生命科学-特集科学の新たなパラダイム? AIで変わる科学の方法. 現代化学 = Chemistry today. 2023. 629. 28-30
井澤和也, 井澤和也, 柳澤渓甫, 柳澤渓甫, 大上雅史, 大上雅史, 秋山泰, 秋山泰. 標的配列との結合・開放エネルギー推定によるアンチセンス核酸の阻害活性モデルの研究. 情報処理学会研究報告(Web). 2021. 2021. MPS-134
井澤和也, 柳澤渓甫, 柳澤渓甫, 大上雅史, 大上雅史, 秋山泰, 秋山泰. 標的配列との結合・開放エネルギー推定に基づくアンチセンス核酸の阻害活性モデルの研究. 情報処理学会研究報告(Web). 2021. 2021. BIO-65
大上雅史. 構造情報に基づくタンパク質間相互作用の計算予測. ファインケミカル. 2020. 10月号. 25-31
高畠和輝, 伊澤和輝, 秋川元宏, 大上雅史, 秋山泰. 圧縮アミノ酸を利用した二段階のシード探索によるメタゲノム配列相同性検索の改良. 情報処理学会研究報告(Web). 2020. 2020. BIO-61

特許 (7件)：

書籍 (3件)：

講演・口頭発表等 (11件)：

Highly precise protein-protein interaction prediction by integrating template-based and template-free protein docking
(The 2013 Annual Conference of the Japanese Society for Bioinformatics (JSBi2013) 2013)
The MEGADOCK project: Ultra-high-performance protein-protein interaction prediction tools on supercomputing environments
(ACM Conference on Bioinformatics, Computatioal Biology and Biomedical Informatics (ACM-BCB2013) 2013)
MEGADOCK-GPU: Acceleration of Protein-Protein Docking Calculation on GPUs
(ACM Conference on Bioinformatics, Computational Biology and Biomedicine 2013 (ACM-BCB 2013), 2nd International Workshop on Parallel and Cloud-based Bioinformatics and Biomedicine (ParBio2013) 2013)
Highly Precise Protein-Protein Interaction Prediction Based on Consensus Between Template-Based and de Novo Docking Methods
(Great Lakes Bioinformatics Conference 2013 2013)
Protein-protein interaction prediction based on rigid-body docking with ultra-high-performance computing technique: applications to affinity prediction on CAPRI round 21 and interactome analyses
(CAPRI 2013 5th Evaluation Meeting 2013)

学歴 (4件)：

学位 (1件)：

経歴 (7件)：

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委員歴 (10件)：

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受賞 (16件)：

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所属学会 (7件)：

日本生物物理学会 , 生命情報科学若手の会 , 日本データベース学会 , 日本蛋白質科学会 , 日本バイオインフォマティクス学会 , 情報処理学会 , INTERNATIONAL SOCIETY FOR COMPUTATIONAL BIOLOGY

※　J-GLOBALの研究者情報は、researchmapの登録情報に基づき表示しています。登録・更新については、こちらをご覧ください。

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