研究者
J-GLOBAL ID：201401002814332480   更新日: 2024年04月22日

山田 拓司

ヤマダ タクジ | Yamada Takuji
所属機関・部署：
東京工業大学 生命理工学院

東京工業大学 生命理工学院 について


職名： 准教授
ホームページURL (1件)： http://kaken.nii.ac.jp/d/r/10437262.ja.html
研究分野 (1件)： ゲノム生物学
研究キーワード (5件)： バイオインフォマティクス ,  腸内細菌 ,  代謝ネットワーク ,  酵素 ,  応用微生物
競争的資金等の研究課題 (6件)：
  • 2022 - 2028 先進ゲノム解析研究推進プラットフォーム
  • 2022 - 2026 遺伝的素因、生活習慣、腸内細菌叢の多面的解析に基づく前立腺癌の早期診断戦略の構築
  • 2016 - 2021 先進ゲノム解析研究推進プラットフォーム
  • 2014 - 2017 メタゲノム解析による切迫早産例、子宮内膜症例における腟内ならびに腸内細菌叢の解析
  • 2013 - 2016 ヒト腸内細菌叢代謝機構の解明
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論文 (86件)：
  • Nobuhiro Narii, Ling Zha, Tomotaka Sobue, Tetsuhisa Kitamura, Masayo Komatsu, Yoshimitsu Shimomura, Satoshi Shiba, Sayaka Mizutani, Takuji Yamada, Shinichi Yachida. Intestinal Bacteria Fluctuating in Early-Stage Colorectal Cancer Carcinogenesis are Associated with Diet in Healthy Adults. Nutrition and cancer. 2024. 1-8
  • Hirotsugu Shiroma, Youssef Darzi, Etsuko Terajima, Zenichi Nakagawa, Hirotaka Tsuchikura, Naoki Tsukuda, Yuki Moriya, Shujiro Okuda, Susumu Goto, Takuji Yamada. Enteropathway: the metabolic pathway database for the human gut microbiota. 2023
  • Sayaka Tsuchida, Atsushi Ueda, Steven Kakooza, Torahiko Okubo, Eddie M Wampande, Takuji Yamada, Kazunari Ushida. The fecal microbiomes analysis of Marabou storks (Leptoptilos crumenifer) reveals their acclimatization to the feeding environment in the Kampala urban areas, Uganda. The Journal of veterinary medical science. 2023. 85. 4. 450-458
  • Ryza Rynazal, Kota Fujisawa, Hirotsugu Shiroma, Felix Salim, Sayaka Mizutani, Satoshi Shiba, Shinichi Yachida, Takuji Yamada. Leveraging explainable AI for gut microbiome-based colorectal cancer classification. Genome biology. 2023. 24. 1. 21-21
  • 森 宙史, 藤澤 貴智, 東 光一, 中村 保一, 山田 拓司, 松井 求, 内山 郁夫. 微生物バイオインフォマティクスの最前線 マイクロバイオーム研究を先導するハブを目指したMicrobiome Datahubの開発. 日本細菌学雑誌. 2023. 78. 1. 30-30
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MISC (63件)：
  • 森宙史, 藤澤貴智, 東光一, 中村保一, 山田拓司, 松井求, 内山郁夫. マイクロバイオーム研究を先導するハブを目指したMicrobiome Datahubの開発. 日本細菌学雑誌(Web). 2023. 78. 1
  • 藤澤 貴智, 平川 英樹, 守屋 勇樹, 信定 知江, 金谷 重彦, 有田 正規, 田畑 哲之, 磯部 祥子, 東 光一, 中村 保一, et al. MicrobeDB.jpからMicrobiome Datahubへ: 微生物・植物・メタボロームのデータ統合と統合微生物データベースの再構築. トーゴーの日2022. 2022. 1
  • 森宙史, 藤澤貴智, 西出浩世, 矢口貴志, 高橋弘喜, 中川善一, 山田拓司, 内山郁夫, 中村保一, 黒川顕. 微生物統合データベースMicrobeDB.jpを用いたマイクロバイオーム研究への応用. 日本ゲノム微生物学会年会要旨集. 2022. 16th (Web)
  • 森 宙史, 藤澤 貴智, 西出 浩世, 矢口 貴志, 高橋 弘喜, 中川 善一, 山田 拓司, 内山 郁夫, 中村 保一, 黒川 顕. 微生物統合データベースMicrobeDB.jpと微生物群集解析. トーゴーの日2021. 2021. 1
  • 水谷紗弥佳, 水谷紗弥佳, 山田拓司, 山田拓司, 山田拓司, 山田拓司. 口腔細菌叢 口腔内細菌と大腸がん進行の関連. 実験医学. 2021. 39. 16. 2527-2531
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経歴 (5件)：
  • 2016/04 - 現在 東京工業大学 生命理工学院 准教授
  • 2013/04 - 2016/03 東京工業大学 大学院・生命理工学研究科 講師
  • 2010/04 - 2012/03 EMBL Senior Technical Officer
  • 2007/04 - 2010/03 EMBL Postdoctoral Fellow
  • 2006/04 - 2007/03 京都大学 化学研究所 特任助手
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